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题名不同品种猪肠道菌群结构差异比较分析
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作者
周浩
刘闯
韩锦仪
冯浩义
李新建
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机构
河南农业大学动物科技学院
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出处
《家畜生态学报》
北大核心
2025年第6期55-62,共8页
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基金
科技部“十四五”国家重点研发计划北方区地方猪新品种(配套系)培育及良繁(2021YFD1301202)
河南省农业农村厅农业良种攻关项目生猪种质创新及新品种培育(2022020101)。
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文摘
本研究旨在探究猪种对肠道菌群组成的影响,分析不同品种猪肠道菌群在结构组成上的特点和差异,以期为生猪种质创新提供理论依据。在相同饲养条件下,选取日龄相近的大白猪、长白猪、杜洛克猪和皮特兰猪各10头,利用16S rRNA基因测序技术对其直肠内容物进行肠道菌群分析。结果显示,不同猪种的肠道菌群在组成结构上存在差异,其中皮特兰猪与其他三个猪种菌群组成存在较大的非显著差异。门水平分类上,4个猪种的优势菌门相同,均为厚壁菌门(Fimicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和螺旋菌门(Spirochaetes),但皮特兰猪在厚壁菌门上显著低于其他三个品种(P<0.05),在拟杆菌门上显著高于其他三个品种(P<0.05)。Alpha多样性指数比较,皮特兰猪在Chao 1指数和Faith_pd指数显著高于杜洛克猪(P<0.05),在Observed_species指数显著高于大白猪(P<0.05),极显著高于杜洛克猪(P<0.01)。利用LEfSe分析,在4个品种中富集到21种差异菌,其中短芽孢杆菌属(g_Brevibacillus)、芽孢杆菌目(o_Bacillales)和类芽孢杆菌科(f_Paenibacillaceae)是杜洛克肠道菌群中的特异菌;拟杆菌属(g_Bacteroides)、拟杆菌科(f_Bacteroidaceae)和g_Ruminiclostridium_5是长白猪肠道菌群中的特异菌;拟杆菌纲(c_Bacteroidia)、拟杆菌门(p_Bacteroidia)等14种菌是皮特兰肠道菌群的特异菌;大白猪肠道菌群的特异菌仅有厚壁菌门(p_Firmicute)。功能预测结果显示,4个品种猪之间均存在显著于其他品种的二级通路(P<0.05)。验证分析结果表明,拟杆菌门、厚壁菌门与背膘厚之间存在一定的关联。本研究揭示了肠道菌群与品种之间的关系,发现4个品种猪的肠道菌群在结构上显示出组间差异,且皮特兰组的肠道菌群在厚壁菌门和拟杆菌门均显著于其他三组(P<0.05),证明猪品种与肠道微生物之间存在一定关联。
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关键词
猪
16S
rRNA基因
肠道菌群
品种
高通量测序技术
菌群结构
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Keywords
pig
16S rRNA gene
intestinal microbiota
varieties
high-throughput sequencing
microbial community structure
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分类号
S828
[农业科学—畜牧学]
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