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玉米NF-YA家族基因的生物信息学分析与克隆
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作者 关秀生 刘铁山 +7 位作者 王娟 张茂林 刘春晓 董瑞 关海英 刘强 徐扬 何春梅 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第8期1605-1614,共10页
核因子Y(nuclear factor Y,NF-Y)由NF-YA、NF-YB和NF-YC亚基组成,能特异性识别靶基因启动子的CCAAT-box,是重要的转录因子。为探索玉米(Zea mays)NF-YA家族成员的功能,利用玉米基因数据库对玉米NF-YA家族16个成员进行生物信息学分析,成... 核因子Y(nuclear factor Y,NF-Y)由NF-YA、NF-YB和NF-YC亚基组成,能特异性识别靶基因启动子的CCAAT-box,是重要的转录因子。为探索玉米(Zea mays)NF-YA家族成员的功能,利用玉米基因数据库对玉米NF-YA家族16个成员进行生物信息学分析,成功克隆了13个成员,并测定了各成员的组织表达模式与盐胁迫下的表达规律。结果显示,除ZmNF-YA16外,玉米其他NF-YA家族成员均含有高度保守的CBFB_NF-YA结构域。系统进化分析表明,玉米NF-YA家族成员可分为3类。亚细胞定位预测显示,除ZmNF-YA14定位于细胞核和线粒体外,其他成员均定位于细胞核。启动子顺式作用原件分析表明,玉米NF-YA家族成员基因含有多种顺式作用元件。组织表达分析表明,5个玉米NF-YA家族成员表现出组织特异性,ZmNF-YA2、ZmNF-YA4在检测的所有组织中都有表达。盐胁迫条件下,ZmNF-YA5和ZmNF-YA10表现出正响应模式,而ZmNF-YA13则负调控玉米对盐胁迫的响应。本研究初步分析了玉米NF-YA家族成员的基因结构和盐胁迫响应规律,为进一步研究该家族成员的功能提供基础。 展开更多
关键词 玉米 核因子Y(NF-Y) NF-YA亚基 盐胁迫
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