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杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析
被引量:
6
1
作者
魏明科
俞金健
+4 位作者
黄晓龙
刘琼瑶
黄华宏
林二培
童再康
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期49-59,共11页
【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录...
【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录组测序获得的相关数据,分离杉木Cl NAC1的c DNA序列,进行同源比对和进化树构建分析。利用实时荧光定量PCR技术(q PCR)检测Cl NAC1的表达模式。通过MEGA 6.0和Dna SP 5.0分析Cl NAC1在40个杉木无性系的SNP变异,以及LD衰减程度。【结果】分离到Cl NAC1基因c DNA序列1 286 bp,开放阅读框(ORF)长度为1 092 bp,编码蛋白质在N端含有1个由128个氨基酸残基组成的NAC结构域。相应基因组序列长2 546 bp,有3个外显子和3个内含子,且第1个内含子位于5'非翻译区(UTR)。系统进化树分析表明,Cl NAC1蛋白位于B分支,与拟南芥的NST1/2/3、毛果杨的Ptr WND2A/B等聚在一起,属于次生生长相关的NAC转录因子类别。Cl NAC1在雄球花中的表达量最大,在当年生成熟叶中最小;该基因在当年生半木质化茎中的表达量是未木质化茎的2.8倍,且在去年生茎木质部中的表达量比皮层大3倍左右。利用来自6个地理种源的40个无性系发现Cl NAC1内存在104个常见SNP位点,平均发生频率为1/24 bp,多样性水平达到0.012 53。编码区域有32个SNP位点,其中25个属于同义突变,7个属于错义突变。SNP多样性指数πtot、πsil、πs、πn在6个群体间的差异不显著,且不同群体的非同义突变多样性πn皆小于同义突变多样性πs。LD分析显示,当r2>0.1时,在6个群体中LD衰退序列长度在1 025~2 460 bp间变化,在基因内部LD水平已衰退至不显著。【结论】杉木Cl NAC1基因可能参与次生壁的发育。Cl NAC1在不同无性系间存在丰富的SNP变异,且在进化中主要受纯化选择作用。不同杉木群体中Cl NAC1基因SNP位点间的LD皆在较短序列长度内迅速消失,表明基于候选基因的LD作图策略在杉木关联作图研究中是可行的。
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关键词
杉木
NAC转录因子
基因表达
SNP
连锁不平衡
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职称材料
临海市松材线虫病松林不同除治方式的群落自然演替特征
被引量:
9
2
作者
孙薇
俞金健
+2 位作者
楼炉焕
丁凯
童再康
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022年第4期40-47,共8页
以浙江省临海市感染松材线虫病后松树皆伐和择伐两种除治方式的试验林为研究对象,采用样地调查的方法记录试验样地植被种类、乔木树高与胸径以及乔木幼树、灌木与草本植物的覆盖度,分析除治迹地自然演替林分的结构、优势种和演替特征。...
以浙江省临海市感染松材线虫病后松树皆伐和择伐两种除治方式的试验林为研究对象,采用样地调查的方法记录试验样地植被种类、乔木树高与胸径以及乔木幼树、灌木与草本植物的覆盖度,分析除治迹地自然演替林分的结构、优势种和演替特征。结果显示:(1)皆伐样地乔木层、下木层与灌草层共有植物24种,择伐样地共有42种,两类样地的乔木层树高均呈近正态分布,胸径呈“J型分布”。(2)皆伐样地马尔可夫模型(Margalef)指数4.037,择伐样地6.761。林分结构呈类似自然林的聚集分布,生物多样性显著高于原马尾松林。(3)皆伐样地已演替为枫香和朴树为主的落叶阔叶林,马尾松消失,下木层优势种为朴树,预测该林分将长期为落叶阔叶林;择伐样地马尾松仍为乔木层的优势种,伴生枫香和樟树等阔叶树种,下木层优势种为白栎,预测现存的针阔混交林将向常绿落叶阔叶混交林过渡。基于松材线虫病除治迹地林分自然恢复慢、林相残破、生态经济价值低等问题,提出需依据林分演替方向选择彩色珍贵树种进行补植更新措施。
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关键词
松材线虫
迹地更新
森林结构
森林演替
马尾松
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职称材料
基于上肢活动状态的冲锋衣袖结构优化
被引量:
4
3
作者
赵欣蕾
薛哲彬
俞金健
《纺织高校基础科学学报》
CAS
2022年第2期28-35,共8页
针对市售大部分冲锋衣的衣袖设计较难兼具美观性和舒适性的问题,提出几种结构改进方案。首先采用市场调研结合理论分析对当前主流冲锋衣衣袖部位的优缺点进行探讨,再采用实证研究法对冲锋衣衣袖进行结构改进,最后通过主观评价和试穿实...
针对市售大部分冲锋衣的衣袖设计较难兼具美观性和舒适性的问题,提出几种结构改进方案。首先采用市场调研结合理论分析对当前主流冲锋衣衣袖部位的优缺点进行探讨,再采用实证研究法对冲锋衣衣袖进行结构改进,最后通过主观评价和试穿实验对改进的效果进行舒适性验证。结果显示:通过增加肘省可有效增强衣袖在人体静止站立时的美观性;在插肩袖的基础上增加腋下褶裥可有效增强服装的运动舒适性;通过增加袖裆能较好地解决衣袖腋下面料堆积过多的问题,同时使服装具有一定的运动舒适性;在袖筒上增加钉扣可改变袖长,但由于长度固定,具有局限性。
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关键词
衣袖结构
冲锋衣
服装性能
结构设计
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职称材料
题名
杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析
被引量:
6
1
作者
魏明科
俞金健
黄晓龙
刘琼瑶
黄华宏
林二培
童再康
机构
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期49-59,共11页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0600201)
浙江省农业新品种选育重大科技专项(2016C02056-5)
文摘
【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录组测序获得的相关数据,分离杉木Cl NAC1的c DNA序列,进行同源比对和进化树构建分析。利用实时荧光定量PCR技术(q PCR)检测Cl NAC1的表达模式。通过MEGA 6.0和Dna SP 5.0分析Cl NAC1在40个杉木无性系的SNP变异,以及LD衰减程度。【结果】分离到Cl NAC1基因c DNA序列1 286 bp,开放阅读框(ORF)长度为1 092 bp,编码蛋白质在N端含有1个由128个氨基酸残基组成的NAC结构域。相应基因组序列长2 546 bp,有3个外显子和3个内含子,且第1个内含子位于5'非翻译区(UTR)。系统进化树分析表明,Cl NAC1蛋白位于B分支,与拟南芥的NST1/2/3、毛果杨的Ptr WND2A/B等聚在一起,属于次生生长相关的NAC转录因子类别。Cl NAC1在雄球花中的表达量最大,在当年生成熟叶中最小;该基因在当年生半木质化茎中的表达量是未木质化茎的2.8倍,且在去年生茎木质部中的表达量比皮层大3倍左右。利用来自6个地理种源的40个无性系发现Cl NAC1内存在104个常见SNP位点,平均发生频率为1/24 bp,多样性水平达到0.012 53。编码区域有32个SNP位点,其中25个属于同义突变,7个属于错义突变。SNP多样性指数πtot、πsil、πs、πn在6个群体间的差异不显著,且不同群体的非同义突变多样性πn皆小于同义突变多样性πs。LD分析显示,当r2>0.1时,在6个群体中LD衰退序列长度在1 025~2 460 bp间变化,在基因内部LD水平已衰退至不显著。【结论】杉木Cl NAC1基因可能参与次生壁的发育。Cl NAC1在不同无性系间存在丰富的SNP变异,且在进化中主要受纯化选择作用。不同杉木群体中Cl NAC1基因SNP位点间的LD皆在较短序列长度内迅速消失,表明基于候选基因的LD作图策略在杉木关联作图研究中是可行的。
关键词
杉木
NAC转录因子
基因表达
SNP
连锁不平衡
Keywords
Cunninghamia lanceolata
NAC transcription factor
gene expression
single nucleotide polymorphism
linkage disequilibrium
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
临海市松材线虫病松林不同除治方式的群落自然演替特征
被引量:
9
2
作者
孙薇
俞金健
楼炉焕
丁凯
童再康
机构
临海市林业技术推广和场圃旅游服务总站
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022年第4期40-47,共8页
基金
中央财政林业科技推广示范资金项目(2021TS13)。
文摘
以浙江省临海市感染松材线虫病后松树皆伐和择伐两种除治方式的试验林为研究对象,采用样地调查的方法记录试验样地植被种类、乔木树高与胸径以及乔木幼树、灌木与草本植物的覆盖度,分析除治迹地自然演替林分的结构、优势种和演替特征。结果显示:(1)皆伐样地乔木层、下木层与灌草层共有植物24种,择伐样地共有42种,两类样地的乔木层树高均呈近正态分布,胸径呈“J型分布”。(2)皆伐样地马尔可夫模型(Margalef)指数4.037,择伐样地6.761。林分结构呈类似自然林的聚集分布,生物多样性显著高于原马尾松林。(3)皆伐样地已演替为枫香和朴树为主的落叶阔叶林,马尾松消失,下木层优势种为朴树,预测该林分将长期为落叶阔叶林;择伐样地马尾松仍为乔木层的优势种,伴生枫香和樟树等阔叶树种,下木层优势种为白栎,预测现存的针阔混交林将向常绿落叶阔叶混交林过渡。基于松材线虫病除治迹地林分自然恢复慢、林相残破、生态经济价值低等问题,提出需依据林分演替方向选择彩色珍贵树种进行补植更新措施。
关键词
松材线虫
迹地更新
森林结构
森林演替
马尾松
Keywords
Bursaphelenchus xylophilus
slash regeneration
forest structure
forest succession
Pinus massoniana Lamb.
分类号
S763 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
基于上肢活动状态的冲锋衣袖结构优化
被引量:
4
3
作者
赵欣蕾
薛哲彬
俞金健
机构
苏州大学纺织与服装工程学院
江苏华佳丝绸有限公司
出处
《纺织高校基础科学学报》
CAS
2022年第2期28-35,共8页
基金
国家丝绸重点实验室开放基金(KJS2057)。
文摘
针对市售大部分冲锋衣的衣袖设计较难兼具美观性和舒适性的问题,提出几种结构改进方案。首先采用市场调研结合理论分析对当前主流冲锋衣衣袖部位的优缺点进行探讨,再采用实证研究法对冲锋衣衣袖进行结构改进,最后通过主观评价和试穿实验对改进的效果进行舒适性验证。结果显示:通过增加肘省可有效增强衣袖在人体静止站立时的美观性;在插肩袖的基础上增加腋下褶裥可有效增强服装的运动舒适性;通过增加袖裆能较好地解决衣袖腋下面料堆积过多的问题,同时使服装具有一定的运动舒适性;在袖筒上增加钉扣可改变袖长,但由于长度固定,具有局限性。
关键词
衣袖结构
冲锋衣
服装性能
结构设计
Keywords
sleeve structure
outdoor jacket
garment performance
structure design
分类号
TS941.26 [轻工技术与工程—服装设计与工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析
魏明科
俞金健
黄晓龙
刘琼瑶
黄华宏
林二培
童再康
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
临海市松材线虫病松林不同除治方式的群落自然演替特征
孙薇
俞金健
楼炉焕
丁凯
童再康
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于上肢活动状态的冲锋衣袖结构优化
赵欣蕾
薛哲彬
俞金健
《纺织高校基础科学学报》
CAS
2022
4
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