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非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络（英文）
被引量：
1
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作者
赵琛
万学超
+3 位作者
伊传友
秦睿
孔哲
黄燕
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期305-315,共11页
目的研究PTCH1-3’-UTR对lnc RNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通...
目的研究PTCH1-3’-UTR对lnc RNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs可能的生物学功能。通过TCGA数据分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与NSCLC患者生存率的直接关系。结果荧光定量PCR验证了PTCH1-3’-UTR上调表达的lnc RNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511)。GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak-STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关。TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs中,NSCLC患者中高表达lnc RNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lnc RNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ10038者可能预示高存活率。结论本研究结果提示了PTCH1-3’-UTR的功能,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNA可作为NSCLC预后标志物。
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关键词
长链非编码RNA
PTCH1-3’-UTR
内源竞争性RNA网络
表达谱
非小细胞肺癌
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职称材料
题名
非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络（英文）
被引量：
1
1
作者
赵琛
万学超
伊传友
秦睿
孔哲
黄燕
机构
复旦大学遗传工程国家重点实验室-生命科学学院遗传学研究所
出处
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期305-315,共11页
基金
上海市自然科学基金(14ZR1403700)
国家自然科学基金面上项目(81773024)~~
文摘
目的研究PTCH1-3’-UTR对lnc RNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs可能的生物学功能。通过TCGA数据分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与NSCLC患者生存率的直接关系。结果荧光定量PCR验证了PTCH1-3’-UTR上调表达的lnc RNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511)。GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak-STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关。TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs中,NSCLC患者中高表达lnc RNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lnc RNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ10038者可能预示高存活率。结论本研究结果提示了PTCH1-3’-UTR的功能,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNA可作为NSCLC预后标志物。
关键词
长链非编码RNA
PTCH1-3’-UTR
内源竞争性RNA网络
表达谱
非小细胞肺癌
Keywords
long non coding RNA
PTCH1- 3 ＇- UTR
competing endogenons RNA network
expression profiling
non small cell lung cancer
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络（英文）
赵琛
万学超
伊传友
秦睿
孔哲
黄燕
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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引证文献
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