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大麦条纹病菌GH17基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
任睿斌
司二静
+7 位作者
万广有
汪军成
姚立蓉
张宏
马小乐
李葆春
王化俊
孟亚雄
《生物技术通报》
北大核心
2025年第8期146-154,共9页
【目的】糖苷水解酶17(glycoside hydrolase 17, GH17)在植物、动物和真菌的多种生理及致病过程中发挥重要作用,对大麦条纹病菌PgGH17家族成员进行鉴定和分析,为后续深入研究GH17基因功能提供科学依据,同时为解析大麦条纹病菌的致病性...
【目的】糖苷水解酶17(glycoside hydrolase 17, GH17)在植物、动物和真菌的多种生理及致病过程中发挥重要作用,对大麦条纹病菌PgGH17家族成员进行鉴定和分析,为后续深入研究GH17基因功能提供科学依据,同时为解析大麦条纹病菌的致病性基因功能和探究寄主-病原互动机制奠定坚实的理论基础。【方法】以大麦条纹病菌为研究对象,通过生物信息学方法,对基因家族进行鉴定及分析,经实时荧光定量PCR(RT-qPCR)监测大麦条纹病菌感染过程中各基因不同时间点的表达变化。【结果】PgGH17基因家族含有6个成员,氨基酸序列长度为305-648 aa,均为亲水性蛋白,等电点为5.06-8.66,脂肪指数为65.43-82.00,信号肽长度为0-22 aa,且大多定位在细胞外基质,只有1个基因具有跨膜结构。内含子数为1-3个,进化分析表明,该基因家族成员可聚成7个亚族。RT-q PCR结果表明,除PgGH17-3外,其他PgGH17基因在侵染过程中的表达水平基本呈现先上升后下降的趋势。【结论】从大麦条纹病菌中鉴定出6个GH17家族成员,除GH17-3外,其他GH17基因在侵染过程中表达均增强,说明其参与了病原菌的致病性。
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关键词
大麦条纹病菌
糖苷水解酶17(GH17)
基因家族
基因表达分析
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题名
大麦条纹病菌GH17基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
任睿斌
司二静
万广有
汪军成
姚立蓉
张宏
马小乐
李葆春
王化俊
孟亚雄
机构
省部共建干旱生境作物学国家重点实验室甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室
甘肃农业大学农学院
甘肃农业大学生命科学技术学院
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第8期146-154,共9页
基金
国家大麦青稞产业技术体系项目(CARS-05-03B-03)
国家自然科学基金项目(31960426,32160496)
甘肃省自然科学基金重点项目(24JRRA637)。
文摘
【目的】糖苷水解酶17(glycoside hydrolase 17, GH17)在植物、动物和真菌的多种生理及致病过程中发挥重要作用,对大麦条纹病菌PgGH17家族成员进行鉴定和分析,为后续深入研究GH17基因功能提供科学依据,同时为解析大麦条纹病菌的致病性基因功能和探究寄主-病原互动机制奠定坚实的理论基础。【方法】以大麦条纹病菌为研究对象,通过生物信息学方法,对基因家族进行鉴定及分析,经实时荧光定量PCR(RT-qPCR)监测大麦条纹病菌感染过程中各基因不同时间点的表达变化。【结果】PgGH17基因家族含有6个成员,氨基酸序列长度为305-648 aa,均为亲水性蛋白,等电点为5.06-8.66,脂肪指数为65.43-82.00,信号肽长度为0-22 aa,且大多定位在细胞外基质,只有1个基因具有跨膜结构。内含子数为1-3个,进化分析表明,该基因家族成员可聚成7个亚族。RT-q PCR结果表明,除PgGH17-3外,其他PgGH17基因在侵染过程中的表达水平基本呈现先上升后下降的趋势。【结论】从大麦条纹病菌中鉴定出6个GH17家族成员,除GH17-3外,其他GH17基因在侵染过程中表达均增强,说明其参与了病原菌的致病性。
关键词
大麦条纹病菌
糖苷水解酶17(GH17)
基因家族
基因表达分析
Keywords
Pyrenophora graminea
glycoside hydrolase 17(GH17)
gene family
gene expression analysis
分类号
S435.12 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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作者
出处
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1
大麦条纹病菌GH17基因家族的鉴定及表达分析
任睿斌
司二静
万广有
汪军成
姚立蓉
张宏
马小乐
李葆春
王化俊
孟亚雄
《生物技术通报》
北大核心
2025
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