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猪源奇异变形杆菌的分离鉴定与生物学分析 被引量:29
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作者 任梅渗 王印 +2 位作者 杨泽晓 姚学萍 林星宇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1093-1097,共5页
目的从四川省某规模化养猪场病死猪肝脏分离到一株奇异变形杆菌,分析其生物学特性,为临床鉴别诊断和治疗提供参考。方法对分离株进行革兰氏染色、培养特性观察、毒力试验、生化试验、药敏试验以及16SrRNA基因序列分析,并且构建系统进化... 目的从四川省某规模化养猪场病死猪肝脏分离到一株奇异变形杆菌,分析其生物学特性,为临床鉴别诊断和治疗提供参考。方法对分离株进行革兰氏染色、培养特性观察、毒力试验、生化试验、药敏试验以及16SrRNA基因序列分析,并且构建系统进化树。结果分离株16SrRNA测序结果经BLAST对比分析,其与各株奇异变形杆菌同源性均为98%以上,将分离株与GenBank中其他6株不同来源的变形杆菌与3株不同来源的肠杆菌科细菌进行序列对比分析并且构建系统进化树,证明分离株与猪源奇异变形杆菌(HQ259935.1)的同源性最高,为99.8%;与大肠杆菌,沙门氏菌,克雷伯氏菌的同源性仅为92.1%~93.2%。致病性试验表明分离株对小鼠LD50为1.86×106 CFU/只。分离株对氨基糖苷类和β-内酰胺类药物中度敏感,对其他种类药物敏感性较低。结论分离株经鉴定为猪源奇异变形杆菌,具有较高的耐药性和致病性。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 分离鉴定 16S RRNA
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猪源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及荚膜血清分型 被引量:14
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作者 林星宇 胡凌 +5 位作者 王印 杨泽晓 姚学萍 肖璐 任梅渗 曾相杰 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第4期558-562,共5页
为了解各血清型的多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)在四川、重庆、云南的流行情况,对2013—2014年间四川、重庆、云南等地8个规模化养殖场的125份病死猪肺炎样品进行细菌分离,并用PCR方法对分离的多杀性巴氏杆菌进行鉴定及荚... 为了解各血清型的多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)在四川、重庆、云南的流行情况,对2013—2014年间四川、重庆、云南等地8个规模化养殖场的125份病死猪肺炎样品进行细菌分离,并用PCR方法对分离的多杀性巴氏杆菌进行鉴定及荚膜血清分型。结果表明:从有肺炎症状病死猪的肺脏样品中共分离出11株多杀性巴氏杆菌,其中有7株为A血清型(63.6%),3株为D血清型(27.3%),1株为F血清型(9.1%),没有发现B和E血清型。表明在该区域内,猪肺疫主要是由A型Pm感染引起。另外,此次还分离出了1株较少见的F型多杀性巴氏杆菌。该结果可为上述地区巴氏杆菌病的防治提供科学材料。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 聚合酶链式反应(PCR) 血清分型
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一株副乳房链球菌的分离鉴定及生物学分析 被引量:5
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作者 任梅渗 王印 +3 位作者 杨泽晓 姚学萍 邬旭龙 肖璐 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期758-762,共5页
从四川省某大型养殖场病死猪肺脏分离到一株副乳房链球菌,观察该菌株的生长特性、染色特性,进行生化鉴定、药敏鉴定、毒力试验以及16S rRNA基因序列进化树分析。结果显示:该分离株的16S rRNA序列与副乳房链球菌的同源性为99%。分离株在... 从四川省某大型养殖场病死猪肺脏分离到一株副乳房链球菌,观察该菌株的生长特性、染色特性,进行生化鉴定、药敏鉴定、毒力试验以及16S rRNA基因序列进化树分析。结果显示:该分离株的16S rRNA序列与副乳房链球菌的同源性为99%。分离株在TSA琼脂培养基上呈光滑圆形,半透明的菌落,在血琼脂上呈β溶血;对小鼠的致病性试验测得LD_(50)为2.06×10~7cfu·只^(-1);药敏试验表明,其对头孢类药物较为敏感,对喹诺酮类、四环素类以及氨基糖苷类不敏感。该研究为该菌的临床诊断、疾病预防、选药治疗等奠定了基础。 展开更多
关键词 副乳房链球菌 16S RRNA 分离鉴定
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11株四川副猪嗜血杆菌分离株外膜蛋白p2基因的序列分析 被引量:2
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作者 肖璐 邬旭龙 +7 位作者 王印 姚学萍 杨泽晓 任梅渗 胡凌 林星宇 罗忠永 曾相杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期585-587,共3页
为了解副猪嗜血杆菌(HPS)OMPP2基因地方菌株的变异特点,本研究对2013年5月至2015年9月分离的11株四川地区HPSOMPP2基因进行序列分析。结果显示11株分离株与25株参考株的核苷酸同源性为93.5%~100%,核苷酸一致性低于90%,总体变... 为了解副猪嗜血杆菌(HPS)OMPP2基因地方菌株的变异特点,本研究对2013年5月至2015年9月分离的11株四川地区HPSOMPP2基因进行序列分析。结果显示11株分离株与25株参考株的核苷酸同源性为93.5%~100%,核苷酸一致性低于90%,总体变异相对较大,尤其HPS-3、-8在OMPP2基因序列的第798~868位插入69个碱基,该变异在国内罕见,这与欧洲株和日本株的OMPP2基因在此位段的变异相似,进化树显示HPS-3和HPS-8株也与欧洲株和日本株亲缘关系最近,其中与Sw114日本株同源性最高(99.2%),因此推测该菌很有可能由日本传入,并且HPS-3和HPS-8株于不同年份从同一地区分离,据此推测HPS-3和HPS-8株很有可能是同一株菌,在该地区持续流行。本研究为四川地区HPS的基因突变和遗传变异研究提供参考资料。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 外膜蛋白 序列分析
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猪源Bb SC-SN株的分离鉴定及其皮肤坏死毒素(DNT)全基因序列分析
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作者 肖璐 邬旭龙 +7 位作者 王印 姚学萍 杨泽晓 胡凌 林星宇 任梅渗 曾相杰 罗忠永 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2016年第12期9-15,共7页
【目的】了解当前支气管败血波氏杆菌(Bb)地方菌株皮肤坏死毒素(DNT)基因的变异特点。【方法】利用分离培养、PCR及16SrRNA扩增片段同源性分析,对采自四川遂宁某规模化猪场有明显萎缩性鼻炎症状的鼻拭子进行病原分离鉴定,并对分离株... 【目的】了解当前支气管败血波氏杆菌(Bb)地方菌株皮肤坏死毒素(DNT)基因的变异特点。【方法】利用分离培养、PCR及16SrRNA扩增片段同源性分析,对采自四川遂宁某规模化猪场有明显萎缩性鼻炎症状的鼻拭子进行病原分离鉴定,并对分离株的DNT基因进行克隆和序列分析,对其抗原域、氨基酸二级结构、特定区域位于蛋白质表面可能性等参数进行预测,分析其B细胞抗原表位。【结果】成功分离得到一株支气管败血波氏杆菌,命名为支气管败血波氏杆菌SC-SN株。分离株DNT基因序列全长4 357bp,与其他11株菌DNT基因的核苷酸序列同源性为93.1%~100.0%,但由于其356位插入碱基A,使得该序列仅编码1 426个氨基酸,与上述11株DNT基因编码的氨基酸序列同源性仅为12.8%~47.0%。遗传进化树显示,SC-SN分离株与S798日本株和未知1株的亲缘关系最近。软件预测结果显示,Bb SC-SN株DNT基因编码氨基酸B细胞抗原表位发生较大变化。【结论】经鉴定,分离株确为支气管败血波氏杆菌,且SC-SN株的DNT基因序列变异较大,第356位插入的碱基A,对其氨基酸序列、ORF及B细胞抗原表位分布产生了较大的影响。 展开更多
关键词 支气管败血波氏杆菌 分离鉴定 皮肤坏死毒素基因
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5种猪病毒性传染病病原的多重PCR检测方法的建立 被引量:12
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作者 冷依伊 任梅渗 +4 位作者 蒙正群 张鹏飞 杨泽晓 姚学萍 王印 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期123-126,共4页
为建立同时检测非洲猪瘟病毒(ASFV)、水疱性口炎病毒(VSV)、猪口蹄疫病毒(FMDV),猪瘟病毒(CSFV)以及猪伪狂犬病病毒(PRV)的多重RT-PCR检测方法,本研究根据Gen Bank中登录的参考病毒株序列,选择各病毒的保守序列设计5对特异性引物,通过... 为建立同时检测非洲猪瘟病毒(ASFV)、水疱性口炎病毒(VSV)、猪口蹄疫病毒(FMDV),猪瘟病毒(CSFV)以及猪伪狂犬病病毒(PRV)的多重RT-PCR检测方法,本研究根据Gen Bank中登录的参考病毒株序列,选择各病毒的保守序列设计5对特异性引物,通过优化反应条件,建立了一种可以同时快速检测以上5种病毒的多重RT-PCR检测方法。结果显示,该方法对不同的细菌或病毒模板扩增结果均为阴性,特异性强;敏感性试验表明该方法对PRV、CSFV、ASFV、VSV和FMDV的核酸最少检出量分别为8.82×10~3拷贝/μL、6.87×10~4拷贝/μL、5.71拷贝/μL、4.93×10~4拷贝/μL和4.32×10~2拷贝/μL。以上结果表明该方法快速、灵敏、特异性强,对以上5种猪病病毒能够进行快速鉴别检测,为其临床诊断与流行病学调查提供了有效的检测方法。 展开更多
关键词 多重PCR 非洲猪瘟病毒 猪口蹄疫病毒 猪水疱性口炎病毒 猪瘟病毒 猪伪狂犬病病毒
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一株牛源肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定与耐药基因型检测 被引量:22
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作者 蒙正群 冷依伊 +4 位作者 任梅渗 刘亚东 王印 姚学萍 杨泽晓 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期534-541,共8页
从病死犊牛肺脏组织中分离到一株革兰阴性短杆菌,进行了细菌分离纯化、生化试验、16SrDNA测序鉴定、小鼠致病性试验、药敏试验,及碳青霉烯类酶与产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)等7种耐药基因的PCR检测。结果鉴定该菌为肺炎克雷伯氏菌,其16S... 从病死犊牛肺脏组织中分离到一株革兰阴性短杆菌,进行了细菌分离纯化、生化试验、16SrDNA测序鉴定、小鼠致病性试验、药敏试验,及碳青霉烯类酶与产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)等7种耐药基因的PCR检测。结果鉴定该菌为肺炎克雷伯氏菌,其16S rDNA扩增序列与GenBank中肺炎克雷伯氏菌同源性达99%。对小鼠致病性强。该菌分离株对氨苄西林、头孢呋辛、复方新诺明、红霉素耐药,而对碳青霉烯类、第四代头孢等受试药物均为敏感。耐药基因PCR检测仅扩增出约862 bp的SHV基因片段,与公布的SHV-1基因序列同源性达99.3%。该牛源克雷伯氏菌分离株耐药表型与耐药基因检测结果一致。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯氏菌 分离鉴定 耐药基因
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猪伪狂犬病病毒致病机理及其变异的研究进展 被引量:11
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作者 冷依伊 任梅渗 +3 位作者 蒙正群 杨泽晓 姚学萍 王印 《养猪》 2016年第5期121-126,共6页
猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)属于疱疹病毒I型,可引起家畜和多种野生动物以发热、呼吸道症状和神经症状为特征的急性传染病。文章对猪伪狂犬病病毒的病原特征、临床症状和致病机理进行描述,尤其是对目前已发现的在致病性中... 猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)属于疱疹病毒I型,可引起家畜和多种野生动物以发热、呼吸道症状和神经症状为特征的急性传染病。文章对猪伪狂犬病病毒的病原特征、临床症状和致病机理进行描述,尤其是对目前已发现的在致病性中存在关键作用的11种主要的糖蛋白,如g E、g D和TK等进行了详细综述,以期为猪伪狂犬病致病机理、基因变异情况和猪伪狂犬病疫苗研究提供依据。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒 流行现状 潜伏感染 致病机理 变异
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两株GI.1型和GI.2型兔出血症病毒RdRp基因的克隆与分析 被引量:1
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作者 庞雪晴 唐诗 +7 位作者 曾红梅 赵位 王印 罗燕 姚学萍 任梅渗 任永军 杨泽晓 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期1286-1296,共11页
为了解兔出血症病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)RdRp基因的遗传稳定性和变异规律,本研究分别克隆了RHDV SCH04株和RHDV2 SCCN03株的RdRp基因,然后对基因序列进行比对和系统发育分析,并通过编码蛋白质的理化性质、信号肽、... 为了解兔出血症病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)RdRp基因的遗传稳定性和变异规律,本研究分别克隆了RHDV SCH04株和RHDV2 SCCN03株的RdRp基因,然后对基因序列进行比对和系统发育分析,并通过编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜区域、二级结构、三级结构、磷酸化和糖基化修饰位点的预测,对RdRp进行生物信息学分析。结果显示,两株RdRp基因序列全长均为1548 bp,编码516个氨基酸。GI.1型RHDV毒株间序列相似性为86.9%~99.9%,GI.2型RHDV毒株间为91.3%~99.9%。GI.1型和GI.2型RHDV毒株间序列相似性为84.3%~88.3%。SCH04株和SCCN03株分别属于GI.1a型和GI.2型RHDV,且SCH04株和SCCN03株的RdRp基因核苷酸序列相似性为84.95%,其编码蛋白存在17个氨基酸差异位点,氨基酸序列相似性为96.71%;二者均属于稳定蛋白,不存在信号肽和跨膜区域;其分子量、等电点、脂溶系数、平均亲水系数和不稳定系数等指标无显著差异。SCH04株RdRp的α螺旋和β转角比例比SCCN03株略高,分别为41.86%和4.26%,而SCCN03株RdRp的延伸链和无规则卷曲比例比SCH04株略高,分别为12.79%和43.41%;SCCN03株RdRp比SCH04株多4个磷酸化位点和1个N-糖基化位点。分析结果表明不同型间RHDV RdRp基因核苷酸变异率较高,GI.1 RHDV毒株间的变异范围大于GI.2 RHDV毒株。SCH04株和SCCN03株RHDV RdRp的氨基酸序列相似性高于核苷酸序列相似性,其二级结构和高级结构差异较小,遗传相对稳定。本研究为RHDV的遗传演变和生物合成等分子病原学研究提供了科学参考。 展开更多
关键词 兔出血症病毒 RDRP 对比分析 生物信息学分析
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基于PMA-qPCR方法检测兽用消毒剂对非洲猪瘟病毒的灭活效率
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作者 杨悦 邵靓 +7 位作者 张鹏飞 陈弟诗 陈婉婷 王印 罗燕 杨泽晓 姚学萍 任梅渗 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期301-307,共7页
为评估规模化猪场生物安全防控水平,拟建立非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)感染性检测方法,并利用该方法检测兽用消毒剂对病毒的灭活效果。使用不同种类的消毒剂处理ASFV,通过PMA-qPCR评估消毒剂对ASFV的灭活效果和筛选... 为评估规模化猪场生物安全防控水平,拟建立非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)感染性检测方法,并利用该方法检测兽用消毒剂对病毒的灭活效果。使用不同种类的消毒剂处理ASFV,通过PMA-qPCR评估消毒剂对ASFV的灭活效果和筛选消毒剂的最佳处理方式。PMA-qPCR结果显示,ASFV对不同类型的消毒剂表现出不同的敏感性,对过硫酸氢钾复合物溶液敏感性最高,该消毒剂按0.5%稀释,20 min内即可有效灭活ASFV。研究结果对生物安全的消毒环节具有一定的参考意义。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 消毒剂 叠氮溴化丙锭 生物安全
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