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利福平耐药与敏感肺结核患者痰液样本微生物菌群多样性对比分析
1
作者 张泓泰 任怡宣 +6 位作者 胡培磊 王嫩寒 李洁 田丽丽 赵琰枫 陈双双 李传友 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期625-633,共9页
目的:利用16S高通量测序技术,探索利福平耐药与利福平敏感肺结核患者呼吸道菌群的差异。方法:收集北京市疾病预防控制中心(70份)和湖南省胸科医院(10份)确诊的肺结核患者的痰液(共80份)进行前瞻性研究,通过痰液样本GeneXpert MTB/RIF检... 目的:利用16S高通量测序技术,探索利福平耐药与利福平敏感肺结核患者呼吸道菌群的差异。方法:收集北京市疾病预防控制中心(70份)和湖南省胸科医院(10份)确诊的肺结核患者的痰液(共80份)进行前瞻性研究,通过痰液样本GeneXpert MTB/RIF检测、靶向rpoB高通量测序(tNGS测序)和利福平药物敏感性试验,将80例患者分为利福平耐药组(RFP-R组,41例;利福平耐药决定区突变)和利福平敏感组(RFP-S组,39例;利福平耐药决定区无突变)。对痰液微生物16S V4区域进行高通量测序,测序结果进行生物信息学分析及统计分析。结果:RFP-R组和RFP-S组共获得41950224个原始16S rRNA序列。RFP-R组的平均操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)为344个,RFP-S组的平均OTU为342个。厚壁菌门(47.72%)、拟杆菌门(22.36%)、变形菌门(14.67%)、放线菌门(7.57%)、梭杆菌门(6.46%)是肺结核患者痰液中检出的主要细菌门,占微生物群落的98.78%。与RFP-S组相比,RFP-R组梭杆菌门(7.531%vs.5.167%;t=2.218,P=0.030)和螺旋体门(0.596%vs.0.246%;t=2.128,P=0.038)相对丰度显著增加。与RFP-S组相比,RFP-R组颤杆菌克属(0.690%vs.0.326%;t=3.112,P=0.003)、产线菌属(0.135%vs.0.030%;t=2.171,P=0.035)、Allisonella菌属(0.046%vs.0.006%;t=3.237,P=0.002)、假单胞菌属(0.205%vs.0.054%;t=2.040,P=0.046)和密螺旋体属(0.601%vs.0.242%;t=2.155,P=0.036)相对丰度显著增加;二氧化碳噬纤维菌属(0.351%vs.0.772%;t=―2.044,P=0.046)和Pauljensenia菌属(2.314%vs.3.706%;t=―2.660,P=0.010)相对丰度显著减少。结论:利福平耐药与敏感结核分枝杆菌感染不影响肺结核患者呼吸道菌群的整体结构,但利福平耐药与敏感患者在2个门(梭杆菌门、螺旋体门)和7个属(颤杆菌克属、产线菌属、Allisonella菌属、假单胞菌属、密螺旋体属、二氧化碳噬纤维菌属、Pauljensenia菌属)的丰度中存在差异,其中二氧化碳噬纤维菌属和Pauljensenia菌属在利福平敏感患者中丰度较高,其余在利福平耐药患者中丰度较高。 展开更多
关键词 结核 肺 痰 利福平 抗药性 生物多样性 细菌
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免疫学检测联合痰涂片和痰培养检测在活动性肺结核临床诊断中的价值 被引量：30
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作者 田丽丽 杨新宇 +12 位作者 代小伟 陈双双 赵琰枫 王嫩寒 张洁 易俊莉 任怡宣 陈昊 樊瑞芳 石伟先 武文清 黄春 丁北川 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第10期1073-1078,共6页
目的分析结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)、结核抗体、痰涂片与痰培养联合检测在活动性肺结核诊断中的临床意义。方法收集2014年1月至2019年12月北京结核病控制研究所门诊收治的疑似活动性肺结核患者715例,最终诊断为活动性肺结核患者... 目的分析结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)、结核抗体、痰涂片与痰培养联合检测在活动性肺结核诊断中的临床意义。方法收集2014年1月至2019年12月北京结核病控制研究所门诊收治的疑似活动性肺结核患者715例,最终诊断为活动性肺结核患者412例(肺结核组),非结核病患者303例(非结核组)。715例患者均行T-SPOT.TB检测、结核抗体检测及痰涂片、痰培养检查;以临床诊断结果为标准,分析4种方法单独及联合检测的临床意义。结果肺结核组患者中,T-SPOT.TB阳性检出率为83.7%(345/412);非结核组患者中,T-SPOT.TB阳性检出率为20.8%(63/303);两组阳性检出率差异有统计学意义(χ^(2)=2.823,P=0.000)。T-SPOT.TB对活动性肺结核检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确度分别为83.7%(345/412)、79.2%(240/303)、84.6%(345/408)、78.2%(240/307)、81.8%[(345+240)/715];4种方法联合诊断的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确度分别为93.7%(386/412)、50.8%(154/303)、72.1%(386/535)、85.6%(154/180)、75.5%[(386+154)/715]。T-SPOT.TB检测、结核抗体检测及痰涂片、痰培养检查的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.815、0.575、0.593、0.715,四项联合检测的AUC为0.894。结论 T-SPOT.TB检测的敏感度、阴性预测值较好,T-SPOT.TB检测联合结核抗体、痰涂片和痰培养检测的敏感度、AUC较高,联合检测可提高对肺结核的诊断效能。 展开更多
关键词 酶联免疫斑点检测 结核 肺 对比研究
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全基因组测序在结核分枝杆菌研究中的应用 被引量：22
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作者 张洁 任怡宣 +1 位作者 潘丽萍 张宗德 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第7期737-740,共4页
全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中,包括结核分枝杆菌谱系或亚种鉴定、区分患者的发病模式,以及识别传染源、超级传播者和确定传播方向,以及用于结核分枝杆菌的耐药性预测和微进化研究等,在临床和公共卫生领域发挥了... 全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中,包括结核分枝杆菌谱系或亚种鉴定、区分患者的发病模式,以及识别传染源、超级传播者和确定传播方向,以及用于结核分枝杆菌的耐药性预测和微进化研究等,在临床和公共卫生领域发挥了很重要的作用。即便如此,目前还存在很多问题需要解决。作者对全基因组测序技术在结核分枝杆菌研究中的相关内容、应用成果及进展进行综述。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 全基因组关联研究 高通量核苷酸测序 分子诊断技术 综述
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改良萋-尼染色法检测分枝杆菌的效果评价 被引量：3
4
作者 蔡杏珊 王嫩寒 +7 位作者 周辉林 张洁 梁启德 田丽丽 许蕴怡 任怡宣 谭耀驹 丁北川 《中国防痨杂志》 CAS 2015年第6期603-606,共4页
目的评估改良萋-尼染色液染色镜检分枝杆菌在痰涂片中的检测效能。方法2014年6月至2014年9月于北京结核病控制研究所和广州市胸科医院顺序纳入就诊，按照临床症状和体征、临床相关检测判断为可疑肺结核病患者835例痰标本共1024份（北京... 目的评估改良萋-尼染色液染色镜检分枝杆菌在痰涂片中的检测效能。方法2014年6月至2014年9月于北京结核病控制研究所和广州市胸科医院顺序纳入就诊，按照临床症状和体征、临床相关检测判断为可疑肺结核病患者835例痰标本共1024份（北京结核病控制研究所435例505份痰标本，广州市胸科医院400例519份痰标本），分别涂片进行传统萋-尼染色法（三步法）镜检、改良萋一尼染色法（二步法）镜检和简单法固体罗氏培养（L-J法），比较两种染色方法结果的一致性，并以L-J法结果为金标准，比较两种染色法阳性检出率的差异、诊断的准确性及可操作性。结果改良萋一尼染色法和传统萋一尼染色法的阳性检出率分别为11．62％（119／1024）和11．91％（122／1024），差异无统计学意义（X^2=3．18，P〉0．05），两法有良好的一致性（Kappa〉0．75）；以L-J法结果为金标准，改良萋-尼染色和传统萋-尼法检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为52．94％（90／170）和56．47％（96／170）；97．66%（834／854）和96．96oA（828／854）。以上两种方法的ROC曲线下面积分别是0．76和0．77，有中等的诊断价值。结论改良萋-尼染色法在检出分枝杆菌方面比传统萋-尼染色法有较好的敏感度与特异度，对于诊断肺结核有较好的诊断价值。 展开更多
关键词 结核 肺/诊断 结核分枝杆菌 染色与标记 显微镜检查 敏感度与特异度
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四种方法联合检测对病原学阴性肺结核的诊断价值 被引量：6
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作者 田丽丽 陈双双 +14 位作者 樊瑞芳 张洁 王嫩寒 陈昊 代小伟 任怡宣 赵琰枫 李传友 丁北川 李波 于兰 易俊莉 王佩 杨新宇 宋卫萍 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第2期144-150,共7页
目的:分析结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)、结核抗体(antibody,TB-Ab)、血红细胞沉降率(erythrocyte sedimentation rate,ESR)、超敏C-反应蛋白(high-sensitivity C-reaction protein,hs-CRP)联合检测在病原学阴性肺结核诊断中的价... 目的:分析结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)、结核抗体(antibody,TB-Ab)、血红细胞沉降率(erythrocyte sedimentation rate,ESR)、超敏C-反应蛋白(high-sensitivity C-reaction protein,hs-CRP)联合检测在病原学阴性肺结核诊断中的价值。方法:收集2020年7月至2022年7月北京市疾病预防控制中心结核病门诊收治的初治且病原学检查阴性的肺结核患者216例(病原学阴性肺结核组),以及同期收治的病原学阳性的初治肺结核患者147例(病原学阳性肺结核组)和其他肺部疾病患者455例(其他肺部疾病组)。均行T-SPOT.TB、TB-Ab、ESR、CRP检测,以临床诊断为标准,分析四种方法单独及联合检测的诊断效能。结果:T-SPOT.TB在病原学阴性肺结核组中检测阳性率为82.4%(178/216),与病原学阳性肺结核组阳性率[87.8%(129/147)]相比较,差异无统计学意义(χ2=1.917,P=0.166),与其他肺部疾病组阳性率28.6%(130/455)相比较差异有统计学意义(χ2=160.746,P=0.000)。T-SPOT.TB对病原学阴性肺结核诊断的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确度分别为82.4%(178/216)、71.4%(325/455)、57.8%(178/308)、89.5%(325/363)、75.0%(503/671);四种方法联合诊断的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确度分别为91.7%(198/216)、53.4%(243/455)、48.3%(198/410)、93.1%(243/261)、65.7%(441/671)。T-SPOT.TB、TB-Ab、ESR、hs-CRP检测ROC曲线下面积(AUC)分别为0.764、0.600、0.529、0.515,联合检测的AUC为0.804。结论:T-SPOT.TB检测病原学阴性肺结核的敏感度、阴性预测值及准确度较好,四种方法联合检测的敏感度、阴性预测值和AUC较高,联合检测可提高病原学阴性肺结核的诊断效能。 展开更多
关键词 结核 肺 临床实验室技术 酶联免疫吸附测定 C反应蛋白 对比研究
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荧光PCR探针熔解曲线技术检测痰标本结核分枝杆菌利福平耐药性的研究 被引量：10
6
作者 王嫩寒 田丽丽 +11 位作者 陈双双 赵琰枫 樊瑞芳 陈昊 任怡宣 张洁 易俊莉 杨新宇 于兰 丁北川 李传友 代小伟 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第6期583-588,共6页
目的:评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescent polymerase chain reaction probe melting curve,MeltPro)技术检测肺结核患者痰标本中结核分枝杆菌耐药性的临床应用价值。方法:收集2021年5月至2022年5月北京市疾病预防控制中心结核病门诊... 目的:评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescent polymerase chain reaction probe melting curve,MeltPro)技术检测肺结核患者痰标本中结核分枝杆菌耐药性的临床应用价值。方法:收集2021年5月至2022年5月北京市疾病预防控制中心结核病门诊收治的GeneXpert MTB/RIF检测阳性的初治肺结核患者的痰标本,对每份标本同时进行涂片镜检、分枝杆菌分离培养、MeltPro技术利福平耐药性检测。分析痰标本荷菌量对MeltPro技术耐药性检测结果的影响;培养阳性菌株行利福平比例法药物敏感性试验(简称“药敏试验”),比较比例法药敏试验、GeneXpert MTB/RIF和MeltPro技术检测利福平耐药率的差异;并以培养阳性菌株利福平比例法药敏试验结果为参考标准,评价MeltPro技术耐药性检测的效能。结果:研究共收集结核分枝杆菌阳性合格痰标本158份(例),经分枝杆菌分离培养获得阳性菌株130株。MeltPro技术检测痰标本结核分枝杆菌利福平耐药的成功率为79.1%(125/158),且随着痰涂片结果等级的升高,检测成功率由“阴性”的59.3%(32/54)上升至“+++”标本的100.0%(18/18);同时,随着GeneXpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌等级的升高,检测成功率也由“极低”的64.5%(20/31)上升至“高”的92.9%(26/28),各等级间差异均有统计学意义(H=22.271,P=0.001;H=15.637,P=0.001)。MeltPro技术的利福平耐药检出率为17.6%(22/125),GeneXpert MTB/RIF方法的利福平耐药检出率为12.7%(20/158),比例法药敏试验的利福平耐药检出率为13.1%(17/130),三者比较差异无统计学意义(χ^(2)=1.537,P=0.464)。以培养阳性菌株比例法药敏试验结果为参考标准,MeltPro技术和GeneXpert MTB/RIF方法检测利福平耐药的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值分别为100.0%(17/17)、94.6%(88/93)、77.3%(17/22)、100.0%(88/88)、0.845和100.0%(17/17)、97.3%(110/113)、85.0%(17/20)、100.0%(110/110)、0.906。结论:MeltPro技术检测肺结核患者痰标本结核分枝杆菌利福平耐药性的敏感度和特异度均较高,可快速准确筛查患者利福平耐药情况,但在基层实验室推广应用时需注意痰标本的质量。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 聚合酶链反应 抗药性 敏感性与特异性
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荧光PCR探针熔解曲线技术检测痰标本中结核分枝杆菌异烟肼耐药性的研究 被引量：7
7
作者 王嫩寒 赵琰枫 +5 位作者 田丽丽 陈双双 陈昊 任怡宣 李传友 代小伟 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第20期2664-2670,共7页
目的评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescence polymerase chain reaction probe melting curve,Melt Pro)技术检测痰标本结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)异烟肼耐药性的应用价值。方法收集2021年5月至2022年5月在北京市疾... 目的评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescence polymerase chain reaction probe melting curve,Melt Pro)技术检测痰标本结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)异烟肼耐药性的应用价值。方法收集2021年5月至2022年5月在北京市疾病预防控制中心结核病门诊Gene Xpert MTB/RIF检测为MTB的(简称MTB阳性)患者痰标本,对每份标本同时进行涂片镜检、分枝杆菌分离培养、Melt Pro技术和线性探针技术(Geno Type MTBDRplus,简称Hain试验)异烟肼耐药检测。分析Melt Pro技术检测痰标本MTB异烟肼的耐药性,痰标本荷菌量对检测结果的影响;以培养阳性菌株异烟肼比例法药敏结果为参考标准,评价Melt Pro技术耐药检测效能。结果收集MTB阳性的合格痰标本157例,经分枝杆菌分离培养获得阳性菌株130株。Melt Pro技术痰标本MTB异烟肼耐药性检测成功率为84.1%(132/157)。不同痰涂片结果等级间,Melt Pro技术检测异烟肼耐药成功的比例差异存在有统计学意义(H=24.169,P=0.000),随痰涂片结果等级的升高,检测成功率由“阴性”标本的64.8%(35/54)升高到“3+”“4+”标本的100%(17/17,6/6);该比例也随Gene Xpert MTB/RIF检测MTB等级的升高而升高,由“极低”标本的54.8%(17/31),到“高”标本的96.4%(27/28),各等级间差异有统计学意义(H=27.763,P=0.000)。Melt Pro技术、Hain试验和药敏试验的异烟肼耐药检出率分别为22.0%(29/132),15.3%(19/124),和14.6%(19/130),三者差异无统计学意义(χ^(2)=2.997,P=0.223)。以培养阳性菌株比例法药敏试验结果为参考标准,Melt Pro技术检测异烟肼耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:84.6%(11/13)、91.2%(93/102)、55%(11/20)、97.9%(93/95),Kappa值为0.614;Hain试验检测异烟肼耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:55.6%(10/18)、92.3%(84/91)、58.8%(10/17)、91.3%(84/92),Kappa值为0.490。结论Melt Pro技术可直接检测痰标本MTB耐药性,快速准确筛查患者耐药情况,缩短耐药筛查时间。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 荧光PCR探针熔解曲线 耐药性检测 痰
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