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题名大豆矮化突变体df1的候选基因鉴定
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作者
刘锦宇
吴士浩
仲威宇
张文韬
朱晓斌
夏正俊
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机构
中国科学院东北地理与农业生态研究所
江苏省农业科学院经济作物研究所
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出处
《土壤与作物》
2025年第2期207-216,共10页
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基金
黑土地保护与利用科技创新工程专项资助(XDA28070400)
国家重点研发计划政府间国际科技创新合作(2022YFE0130300)
国家自然科学基金(U21A20215,32272094).
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文摘
植物在外界物理与化学因素的胁迫下会产生基因突变。这种染色体基因组的变化不但能创造新的遗传变异材料,为植物遗传改良与育种服务,同时也是研究基因功能的重要技术手段。本研究对我国东北地区的大豆主栽品种黑河43进行伽玛射线诱变,获得极度矮化突变体df1。遗传分析显示,df1突变为隐性单基因遗传。对杂合型衍生的df1突变型与正常野生型进行混池测序后,利用鉴定基因的BVF-IGV流程,确定了位于1号染色体上包含69个基因的大片段缺失是引起df1突变的遗传因子。缺失区域序列开发的分子标记与表型间进行连锁分析及野生型与突变型混池的转录组分析结果,佐证了上述结论。根据本研究中野生型与突变型的基因表达谱以及公共资源中5000多份品种的转录组数据分析结果,最终确定Glyma.01G066600等26个基因为候选基因。研究结果为进一步通过精细定位克隆df1的功能基因以及明确其调控大豆生长发育的分子机理奠定了基础。
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关键词
大豆
矮化突变
大片段缺失
BVF-IGA
混池测序
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Keywords
soybean
dwarf
large-fragment deletion
BVF-IGV
bulk sequencing
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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