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3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析: 1; 作者付丽枝杨涌 +3 位作者于克妍于立洋王旋张海娥《山东农业科学》北大核心 2025年第5期36-45,共10页; SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子。本研究从3种栗属植物中鉴定到58个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析。结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成... 展开更多; 关键词栗属植物 SBP基因家族选择压力生物信息学分析表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

3种栗属植物NAC基因家族的鉴定及密码子偏好性分析: 2; 作者付丽枝杨涌 +6 位作者郭江辉刘静王萌王旋王东升于立洋张海娥《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1677-1689,共13页; 【目的】鉴定3种栗属植物NAC基因家族,同时分析其密码子偏好性,为进一步探究栗属植物NAC基因家族功能提供重要理论依据。【方法】使用生物信息学方法,对3种栗属植物的染色体位置、系统进化关系、蛋白基序、所受选择压力、密码子偏好性... 展开更多; 关键词栗属植物 NAC基因家族选择压力密码子偏好性; 在线阅读下载PDF 职称材料

板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性分析被引量：1: 3; 作者杨涌付丽枝 +6 位作者王萌王旋刘静于立洋王东升路艺张海娥《江苏农业科学》北大核心 2024年第21期40-46,共7页; 为明确板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性及其形成原因,利用CodonW与EMBOSS软件对从板栗叶绿体基因组密码子中筛选出来的52条蛋白编码序列进行分析。结果显示,板栗叶绿体基因组密码子中同义密码子相对使用频率超过1的有31个,并且多以A或... 展开更多; 关键词板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性最优密码子; 在线阅读下载PDF 职称材料

红色板栗和绿色板栗叶片光合特性及色素含量比较: 4; 作者杨涌勾荣鑫 +3 位作者付丽枝王萌王东升张海娥《中国果树》 2024年第6期62-67,共6页; 以红色板栗红栗2号和绿色板栗燕宝为材料,通过Li-6400便携式光合仪测定叶片光合参数日变化以及红色板栗与绿色板栗的光响应曲线,同时使用紫外可见分光光度计测定叶片色素含量,探究红色板栗与绿色板栗叶片光合特性差异。结果表明:两种颜... 展开更多; 关键词板栗光合日变化光响应曲线花色素苷叶绿素; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析: 1; 作者付丽枝杨涌于克妍于立洋王旋张海娥; 机构河北科技师范学院园艺科技学院板栗产业技术教育部工程研究中心河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室河北省板栗产业协同创新中心; 出处《山东农业科学》北大核心 2025年第5期36-45,共10页; 基金国家重点研发计划项目(2022YFD2200400) 河北科技师范学院博士启动基金项目(2023YB026); 文摘 SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子。本研究从3种栗属植物中鉴定到58个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析。结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成员在染色体上呈非均匀分布,其中3个SBP基因未被组装到染色体的大片段中。进化树分析发现栗属植物SBP基因家族可以分为7个小组,小组5中发生了基因的丢失和扩增。Motif分析发现所有SBP基因家族成员都包含保守的Motif1或Motif2。共线性基因对的Ka/Ks分析发现,SBP基因家族成员在栗属植物基因组内及组间正在经历纯化选择。转录组数据分析发现CmSBP基因家族在不同时期中国板栗芽与果实中的表达量变化明显。本研究结果可为后续栗属植物SBP基因功能研究提供理论基础。; 关键词栗属植物 SBP基因家族选择压力生物信息学分析表达分析; Keywords Castanea plants SBP gene family Selection pressure Bioinformatics analysis Expression analysis; 分类号 S664.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名3种栗属植物NAC基因家族的鉴定及密码子偏好性分析: 2; 作者付丽枝杨涌郭江辉刘静王萌王旋王东升于立洋张海娥; 机构河北科技师范学院园艺科技学院板栗产业技术教育部工程研究中心河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室河北省板栗产业协同创新中心; 出处《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1677-1689,共13页; 基金国家重点研发计划项目(2022YFD2200400) 河北科技师范学院博士启动基金项目(2023YB026) 河北省重点研发计划项目(21326304D)。; 文摘【目的】鉴定3种栗属植物NAC基因家族,同时分析其密码子偏好性,为进一步探究栗属植物NAC基因家族功能提供重要理论依据。【方法】使用生物信息学方法,对3种栗属植物的染色体位置、系统进化关系、蛋白基序、所受选择压力、密码子偏好性等方面进行分析。【结果】共鉴定到333个栗属植物NAC基因家族成员,其不均等分布在各个染色体上;进化树分析显示其分为5个小组;蛋白基序分析显示5个小组都包含保守的Motif 1~Motif 7;共线性分析显示其在基因组内与组间包含极强的共线性关系且多数共线性基因对都在经历纯化选择压力;密码子偏好性分析显示其密码子偏好性较弱;中性绘图分析与ENCplot绘图分析显示其密码子偏好性受自然选择压力更大;最优密码子分析显示3种栗属植物的NAC基因家族共同包含11个最优密码子,例如CAU、UAA、GUU等;与模式植物比较密码子使用频率发现拟南芥、烟草、番茄均为3种栗属植物合适的外源受体。【结论】本研究探索栗属植物NAC基因家族成员的进化关系、选择压力、密码子偏好性等,为今后通过分子生物学手段提高栗属植物NAC基因表达效率奠定理论基础。; 关键词栗属植物 NAC基因家族选择压力密码子偏好性; Keywords Castanea plants NAC gene family Selection pressure Codon usage bias; 分类号 S664.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性分析被引量：1: 3; 作者杨涌付丽枝王萌王旋刘静于立洋王东升路艺张海娥; 机构河北科技师范学院园艺科技学院板栗产业技术教育部工程研究中心/河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室河北省板栗产业协同创新中心; 出处《江苏农业科学》北大核心 2024年第21期40-46,共7页; 基金国家重点研发计划(编号:2022YFD2200400) 河北省重点研发计划(编号:21326304D) 河北科技师范学院博士启动基金(编号:2023YB026)。; 文摘为明确板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性及其形成原因,利用CodonW与EMBOSS软件对从板栗叶绿体基因组密码子中筛选出来的52条蛋白编码序列进行分析。结果显示,板栗叶绿体基因组密码子中同义密码子相对使用频率超过1的有31个,并且多以A或U结尾,表明板栗叶绿体基因组偏好使用以A或U结尾的密码子;板栗叶绿体基因组蛋白编码序列的有效密码子数平均值为48.04(大于35),说明板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性较弱。板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性参数相关性分析结果显示,板栗叶绿体基因组密码子第1位置GC含量与第2位置GC含量呈极显著相关(P<0.01),而密码子第3位置GC含量与第1、第2位置GC含量无显著相关性(P>0.05),表明板栗叶绿体基因组密码子中第1位置和第2位置碱基组成明显相同,而第3位置碱基与第1、第2位置碱基组成明显不同;此外,ENC值与第3位置GC含量呈显著相关(P<0.05),说明板栗叶绿体基因组密码子第3位置碱基组成在一定程度上会影响其密码子使用偏好性。通过中性绘图、ENC-plot绘图、PR2-plot绘图分析表明,板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性受自然选择压力和突变压力共同影响,但自然选择压力是主要影响因素。最终根据RSCU值与ΔRSCU值从板栗叶绿体基因组密码子中筛选出16个最优密码子。以上研究结果丰富了板栗种质资源的遗传背景信息,为板栗叶绿体基因工程、演化和分类等研究提供了理论基础。; 关键词板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性最优密码子; 分类号 S664.201 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名红色板栗和绿色板栗叶片光合特性及色素含量比较: 4; 作者杨涌勾荣鑫付丽枝王萌王东升张海娥; 机构河北科技师范学院园艺科技学院板栗产业技术教育部工程研究中心河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室河北省板栗产业协同创新中心; 出处《中国果树》 2024年第6期62-67,共6页; 基金国家重点研发计划项目“主要经济林优质高产新品种创制与精准栽培技术”(2022YFD2200400) 河北科技师范学院博士启动基金项目“板栗光效分型及高光效生理机制研究”(2023YB026)。; 文摘以红色板栗红栗2号和绿色板栗燕宝为材料,通过Li-6400便携式光合仪测定叶片光合参数日变化以及红色板栗与绿色板栗的光响应曲线,同时使用紫外可见分光光度计测定叶片色素含量,探究红色板栗与绿色板栗叶片光合特性差异。结果表明:两种颜色板栗净光合速率日变化有明显区别,绿色板栗净光合速率为双峰形曲线,13:00时出现“光合午休”现象,而红色板栗为单峰形,无明显“光合午休”现象;红色板栗气孔导度、蒸腾速率、水分利用率日均值均大于绿色板栗,而胞间二氧化碳浓度日均值小于绿色板栗。光响应曲线结果表明,红色板栗有更高的最大净光合速率、光补偿点、暗呼吸速率、光饱和点与表观量子效率,与绿色板栗差异显著。对叶片色素含量进行分析,红色板栗与绿色板栗类胡萝卜素含量无明显差异,但是叶绿素含量和花色素苷含量差异显著。相关性分析结果表明,光响应特征参数中最大净光合速率、光饱和点与花色素苷含量有极显著正相关性,而光补偿点、暗呼吸速率与叶绿素含量呈现极显著或显著负相关。; 关键词板栗光合日变化光响应曲线花色素苷叶绿素; Keywords Castanea mollissima diurnal variation of photosynthesis light response curve anthocyanin chlorophyll; 分类号 S664.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析	付丽枝杨涌于克妍于立洋王旋张海娥	《山东农业科学》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	3种栗属植物NAC基因家族的鉴定及密码子偏好性分析	付丽枝杨涌郭江辉刘静王萌王旋王东升于立洋张海娥	《西南农业学报》 CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	板栗叶绿体基因组密码子使用偏好性分析	杨涌付丽枝王萌王旋刘静于立洋王东升路艺张海娥	《江苏农业科学》北大核心	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	红色板栗和绿色板栗叶片光合特性及色素含量比较	杨涌勾荣鑫付丽枝王萌王东升张海娥	《中国果树》	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料