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梨叶片总蛋白提取及双向电泳体系的建立
被引量:
12
1
作者
胡敏
徐凌飞
+3 位作者
张军科
仇宗浩
丁勤
张静
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012年第1期197-203,209,共8页
【目的】探索建立有效的梨叶片蛋白质组双向电泳体系,为梨蛋白质组的后续研究提供参考。【方法】以早酥梨叶片为材料,比较蛋白质提取方法、蛋白质裂解时间、IPG胶条的pH梯度和长度、等电聚焦程序及SDS-PAGE电泳参数对梨叶片蛋白双向电...
【目的】探索建立有效的梨叶片蛋白质组双向电泳体系,为梨蛋白质组的后续研究提供参考。【方法】以早酥梨叶片为材料,比较蛋白质提取方法、蛋白质裂解时间、IPG胶条的pH梯度和长度、等电聚焦程序及SDS-PAGE电泳参数对梨叶片蛋白双向电泳结果的影响。【结果】采用第2种改良的三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀法提取梨叶片总蛋白,蛋白质裂解1h,选用长17cm、pH 4~7的IPG胶条及聚焦程序Ⅱ进行等电聚焦,于100V30min、180V 6h条件下进行SDS-PAGE垂直电泳,可以获得背景清晰、重复性好的双向电泳图谱。【结论】建立并优化了适用于梨叶片蛋白质组分析的双向电泳体系。
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关键词
梨
叶片
蛋白质提取
双向电泳
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职称材料
早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析
被引量:
6
2
作者
周鹏
仇宗浩
+2 位作者
翟锐
梁东
徐凌飞
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014年第5期162-170,182,共10页
【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结...
【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】成功从早酥梨基因组和红色芽变材料中分别获得29,30条逆转录酶序列,序列大小均为260bp左右。生物信息学分析表明,与早酥梨相比,红色芽变的逆转录酶序列多发生终止子突变、缺失突变、替换突变。聚类分析可将所得序列分为7个家族,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第7家族序列与苹果和李具有很高的同源性,可能是反转录转座子横向传递的结果。【结论】早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点,虽均已不具备转录活性,但红色芽变的逆转录酶序列突变程度更高。
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关键词
梨
红色芽变
逆转录酶
进化分析
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职称材料
题名
梨叶片总蛋白提取及双向电泳体系的建立
被引量:
12
1
作者
胡敏
徐凌飞
张军科
仇宗浩
丁勤
张静
机构
西北农林科技大学园艺学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012年第1期197-203,209,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31171925)
国家梨产业技术体系建设专项(CARS-29)
文摘
【目的】探索建立有效的梨叶片蛋白质组双向电泳体系,为梨蛋白质组的后续研究提供参考。【方法】以早酥梨叶片为材料,比较蛋白质提取方法、蛋白质裂解时间、IPG胶条的pH梯度和长度、等电聚焦程序及SDS-PAGE电泳参数对梨叶片蛋白双向电泳结果的影响。【结果】采用第2种改良的三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀法提取梨叶片总蛋白,蛋白质裂解1h,选用长17cm、pH 4~7的IPG胶条及聚焦程序Ⅱ进行等电聚焦,于100V30min、180V 6h条件下进行SDS-PAGE垂直电泳,可以获得背景清晰、重复性好的双向电泳图谱。【结论】建立并优化了适用于梨叶片蛋白质组分析的双向电泳体系。
关键词
梨
叶片
蛋白质提取
双向电泳
Keywords
pear
leaf
protein extraction
two-dimensional electrophoresis
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析
被引量:
6
2
作者
周鹏
仇宗浩
翟锐
梁东
徐凌飞
机构
西北农林科技大学园艺学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014年第5期162-170,182,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31171925)
高校基本科研业务费项目(ZD2013005)
文摘
【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】成功从早酥梨基因组和红色芽变材料中分别获得29,30条逆转录酶序列,序列大小均为260bp左右。生物信息学分析表明,与早酥梨相比,红色芽变的逆转录酶序列多发生终止子突变、缺失突变、替换突变。聚类分析可将所得序列分为7个家族,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第7家族序列与苹果和李具有很高的同源性,可能是反转录转座子横向传递的结果。【结论】早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点,虽均已不具备转录活性,但红色芽变的逆转录酶序列突变程度更高。
关键词
梨
红色芽变
逆转录酶
进化分析
Keywords
pears
red mutant
Tyl-copia retrotransposon
phylogenetic analysis
分类号
S661.201 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
梨叶片总蛋白提取及双向电泳体系的建立
胡敏
徐凌飞
张军科
仇宗浩
丁勤
张静
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析
周鹏
仇宗浩
翟锐
梁东
徐凌飞
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014
6
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职称材料
已选择
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引证文献
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