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棉花纤维品质相关性状QTL元分析及候选基因鉴定
1
作者
郭栋财
吕涛
+4 位作者
蔡永生
买吾鲁达·艾合买提
陈全家
曲延英
郑凯
《作物学报》
北大核心
2025年第6期1445-1466,共22页
棉花纤维品质性状是受多基因控制的复杂数量性状,深入挖掘棉花纤维品质数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)和候选基因对棉花纤维品质遗传改良具有重要意义。本研究利用BioMercator 4.2软件,以Blenda A等发布的棉花高密度分子...
棉花纤维品质性状是受多基因控制的复杂数量性状,深入挖掘棉花纤维品质数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)和候选基因对棉花纤维品质遗传改良具有重要意义。本研究利用BioMercator 4.2软件,以Blenda A等发布的棉花高密度分子标记遗传连锁图谱为参考图谱,对来自21个独立纤维品质QTL定位研究中的379个控制棉花纤维品质的原始QTL进行图谱整合、映射以及QTL元分析。获得的74个控制棉花纤维品质性状的一致性meta-QTL(meta quantitative trait loci,MQTL),分布在26条染色体上,置信区间最小为0.5 cM,所有MQTL中共包含13,833个基因。通过RNA-seq、GO和KEGG富集分析,挖掘到32个与棉花纤维品质相关的候选基因。通过qRT-PCR验证发现,这些基因在棉花纤维发育不同时期差异表达,推测其可能参与调控棉花纤维发育。本研究为棉花纤维品质性状分子标记辅助选择育种和基因克隆提供理论依据。
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关键词
棉花
纤维品质
一致性QTL
元分析
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职称材料
题名
棉花纤维品质相关性状QTL元分析及候选基因鉴定
1
作者
郭栋财
吕涛
蔡永生
买吾鲁达·艾合买提
陈全家
曲延英
郑凯
机构
新疆农业大学/新疆作物生物育种重点实验室
出处
《作物学报》
北大核心
2025年第6期1445-1466,共22页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(32301867)
新疆维吾尔自治区重点研发项目(2022B02009-1)
+1 种基金
“天山英才”培养计划项目(2023TSYCLJ0012)
新疆农业大学作物学重点学科发展基金项目(XNCDKY2021016)资助。
文摘
棉花纤维品质性状是受多基因控制的复杂数量性状,深入挖掘棉花纤维品质数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)和候选基因对棉花纤维品质遗传改良具有重要意义。本研究利用BioMercator 4.2软件,以Blenda A等发布的棉花高密度分子标记遗传连锁图谱为参考图谱,对来自21个独立纤维品质QTL定位研究中的379个控制棉花纤维品质的原始QTL进行图谱整合、映射以及QTL元分析。获得的74个控制棉花纤维品质性状的一致性meta-QTL(meta quantitative trait loci,MQTL),分布在26条染色体上,置信区间最小为0.5 cM,所有MQTL中共包含13,833个基因。通过RNA-seq、GO和KEGG富集分析,挖掘到32个与棉花纤维品质相关的候选基因。通过qRT-PCR验证发现,这些基因在棉花纤维发育不同时期差异表达,推测其可能参与调控棉花纤维发育。本研究为棉花纤维品质性状分子标记辅助选择育种和基因克隆提供理论依据。
关键词
棉花
纤维品质
一致性QTL
元分析
Keywords
cotton
fiber quality
consistency QTL
meta-analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
棉花纤维品质相关性状QTL元分析及候选基因鉴定
郭栋财
吕涛
蔡永生
买吾鲁达·艾合买提
陈全家
曲延英
郑凯
《作物学报》
北大核心
2025
0
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