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题名红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析
被引量：1
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作者
刘湘楠
胡祥祥
乔梦燚
周丹宁
朱畇昊
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机构
河南中医药大学药学院
呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心
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出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第6期68-76,共9页
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基金
国家自然科学基金(编号:81603232)
国家重点研发计划(编号:2017YFC1702800)
+1 种基金
河南省重大科技专项(编号:171100310500)
河南省科技攻关项目(编号:172102310539)。
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文摘
为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,研究该基因在红花生长发育中的调控作用,利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理化性质分析,红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白,且79%位于细胞核中,大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性;经聚类分析,将红花Aux/IAA基因分为5个亚族。基因结构分析表明,所有基因均含有1~9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布,其中9号染色体上分布最多,有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IAA基因在不同发育期及不同外源激素处理下表达量各不相同。对保守基序作图分析发现,大部分红花Aux/IAA蛋白具有4个共同的保守基序,分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4,qRT-PCR结果表明,不同浓度盐胁迫处理24 h后,基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势,推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究结果将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。
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关键词
红花
Aux/IAA基因家族
生物信息学分析
盐胁迫
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分类号
S567.219.01
[农业科学—中草药栽培]
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