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基于网络药理学的罗汉果止咳化痰活性成分靶点研究 被引量:11
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作者 吕金燕 黄嘉咏 +4 位作者 袁彩英 霍丽妮 陈睿 严振硕 赖泽锋 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2019年第1期40-48,共9页
为预测罗汉果止咳化痰有效成分、潜在靶点及通路,探讨其"多成分—多靶点—多通路"的止咳化痰作用机制,首先通过TCMSP平台筛选罗汉果内13种具有止咳化痰活性的化学成分;然后利用PharmMapper筛选罗汉果止咳化痰的潜在靶点,同时... 为预测罗汉果止咳化痰有效成分、潜在靶点及通路,探讨其"多成分—多靶点—多通路"的止咳化痰作用机制,首先通过TCMSP平台筛选罗汉果内13种具有止咳化痰活性的化学成分;然后利用PharmMapper筛选罗汉果止咳化痰的潜在靶点,同时借助DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路注释分析;最后采用Cytoseape软件构建罗汉果止咳化痰病的"成分—靶点—通路"网络模型。结果表明,罗汉果的13个活性成分以罗汉果皂苷为主,其可能是通过HNMT,IL2,IGF1,ABO,TRAPPC3,SERPINA1,THRA等37个止咳化痰相关靶点调控Proteplycans in cancer,pathways in cancer,serotonergic synapse,Fox O signaling patheway,Glioma,Melanoma,Renin-angiotensin system等25条信号通路。此外,本文还通过SYBYL软件将罗汉果活性成分与靶点进行分子对接,进一步解析了罗汉果主要活性成分与止咳化痰靶点的作用方式,为下一步探讨其止咳化痰靶点及机制的验证实验指明了方向。 展开更多
关键词 罗汉果 网络药理学 潜在靶点 止咳化痰 分子对接
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基于GEO数据库及网络药理学研究绞股蓝治疗冠心病的作用机制 被引量:2
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作者 刘本涛 袁彩英 +5 位作者 陈睿 梁水月 黄嘉咏 严振硕 梁燕 霍丽妮 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期2885-2892,共8页
目的利用GEO数据库及网络药理学方法研究绞股蓝治疗冠心病(CHD)的作用机制。方法通过GEO数据库筛选CHD相关疾病靶标。检索TCMSP数据库获取绞股蓝主要活性成分,经Swiss Target Prediction数据库预测活性成分潜在靶点,采用Cytoscape3.7.1... 目的利用GEO数据库及网络药理学方法研究绞股蓝治疗冠心病(CHD)的作用机制。方法通过GEO数据库筛选CHD相关疾病靶标。检索TCMSP数据库获取绞股蓝主要活性成分,经Swiss Target Prediction数据库预测活性成分潜在靶点,采用Cytoscape3.7.1软件构建绞股蓝治疗CHD活性成分-作用靶点网络。使用STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,构建核心靶蛋白相互作用(PPI)网络。借助DAVID数据库对绞股蓝治疗CHD作用靶点进行基因本体(GO)功能注释和KEGG通路富集分析,以阐明绞股蓝治疗CHD的作用机制。利用分子对接软件SYBYL对主要活性成分与其核心靶点进行对接验证。结果筛选得到绞股蓝24种活性成分,相关作用靶点43个,主要涉及氨基酸磷酸化、趋化作用、细胞分裂、呼吸急促正调控等生物过程,并通过调节PI3K-Akt、VEGF、PPAR、黏着斑激酶介导等13条主要信号通路来发挥治疗CHD的作用。大多数活性成分与其核心靶点结合活性较好,两者主要通过疏水接触及氢键产生相互作用。结论绞股蓝治疗CHD具有多成分-多靶点-多途径共同作用的特点。 展开更多
关键词 绞股蓝 冠心病 作用机制 GEO数据库 网络药理学
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