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植物SUS基因家族的系统进化及其在玉米中的干旱诱导表达分析
1
作者
吴越
丁鹏钧
+4 位作者
陈君如
王睿蕾
张恺文
刘梦真
韩兆雪
《干旱地区农业研究》
CSCD
北大核心
2023年第3期71-79,共9页
利用生物信息学方法从50个物种内鉴定出283个蔗糖合酶(SUS)家族成员,对鉴定出的SUS家族成员进行系统发育分析、共线性分析、蛋白理化性质和亚细胞定位分析,以及干旱胁迫下玉米SUS基因在不同组织的表达模式分析,综合全面地分析了SUS基因...
利用生物信息学方法从50个物种内鉴定出283个蔗糖合酶(SUS)家族成员,对鉴定出的SUS家族成员进行系统发育分析、共线性分析、蛋白理化性质和亚细胞定位分析,以及干旱胁迫下玉米SUS基因在不同组织的表达模式分析,综合全面地分析了SUS基因家族的进化规律。系统发育树分析表明:SUS家族可划分为SUSⅠ、SUSⅡ、SUSⅢ三个亚家族,SUSⅢ内部双子叶植物进化枝明显分为两个拓扑结构相似的进化枝;亚细胞定位结果显示SUS蛋白主要在细胞质和细胞核中发挥作用,且SUSⅢ成员的理化性质与SUSⅠ、Ⅱ之间差异明显;共线性结果表明:SUSⅠ、Ⅱ中的共线性基因分别聚成一个独立的亚群,SUSⅢ的共线性基因聚成两个亚群;RNA-seq数据表明:玉米SUS基因Zm00001d045042、Zm00001d029087、Zm00001d029091、Zm00001d014876在干旱胁迫下呈现差异表达,该表达模式分别与各亚家族的基因结构模式较为一致。综合上述研究,推测出植物SUS基因的进化轨迹,即在蕨类植物到种子植物进化过程中分化出SUSⅢ,在被子植物分化以前出现SUSⅠ和SUSⅡ,且SUSⅢ在双子叶植物中具有继续分化的趋势。
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关键词
玉米
干旱胁迫
蔗糖合酶(SUS)基因家族
基因表达
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题名
植物SUS基因家族的系统进化及其在玉米中的干旱诱导表达分析
1
作者
吴越
丁鹏钧
陈君如
王睿蕾
张恺文
刘梦真
韩兆雪
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《干旱地区农业研究》
CSCD
北大核心
2023年第3期71-79,共9页
基金
大学生创新创业训练计划项目(S202010712250,S201910712184,X201910712303)
中央高校基本科研业务费专项基金(2452019072)
陕西省自然科学基础研究计划(2021JM-101)。
文摘
利用生物信息学方法从50个物种内鉴定出283个蔗糖合酶(SUS)家族成员,对鉴定出的SUS家族成员进行系统发育分析、共线性分析、蛋白理化性质和亚细胞定位分析,以及干旱胁迫下玉米SUS基因在不同组织的表达模式分析,综合全面地分析了SUS基因家族的进化规律。系统发育树分析表明:SUS家族可划分为SUSⅠ、SUSⅡ、SUSⅢ三个亚家族,SUSⅢ内部双子叶植物进化枝明显分为两个拓扑结构相似的进化枝;亚细胞定位结果显示SUS蛋白主要在细胞质和细胞核中发挥作用,且SUSⅢ成员的理化性质与SUSⅠ、Ⅱ之间差异明显;共线性结果表明:SUSⅠ、Ⅱ中的共线性基因分别聚成一个独立的亚群,SUSⅢ的共线性基因聚成两个亚群;RNA-seq数据表明:玉米SUS基因Zm00001d045042、Zm00001d029087、Zm00001d029091、Zm00001d014876在干旱胁迫下呈现差异表达,该表达模式分别与各亚家族的基因结构模式较为一致。综合上述研究,推测出植物SUS基因的进化轨迹,即在蕨类植物到种子植物进化过程中分化出SUSⅢ,在被子植物分化以前出现SUSⅠ和SUSⅡ,且SUSⅢ在双子叶植物中具有继续分化的趋势。
关键词
玉米
干旱胁迫
蔗糖合酶(SUS)基因家族
基因表达
Keywords
maize
drought stress
sucrose synthase gene family
gene expression
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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作者
出处
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1
植物SUS基因家族的系统进化及其在玉米中的干旱诱导表达分析
吴越
丁鹏钧
陈君如
王睿蕾
张恺文
刘梦真
韩兆雪
《干旱地区农业研究》
CSCD
北大核心
2023
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