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团头鲂bim基因的分子特征、组织表达及其与mam-miR-24-3的关系验证
1
作者
丁思玉
冯雅慧
+3 位作者
LOIC Kemmadzong Foning
陈杰
郑国栋
邹曙明
《水生生物学报》
2025年第10期126-134,共9页
为了明确团头鲂(Megalobrama amblycephala)bim基因的结构和功能,研究通过TA克隆获得其编码区(CDS)全长序列,并利用生物信息学工具系统分析Bim蛋白的一级、二级和三级结构特征。多序列比对显示,团头鲂Bim蛋白与红鳍鲌(Chanodichthys ery...
为了明确团头鲂(Megalobrama amblycephala)bim基因的结构和功能,研究通过TA克隆获得其编码区(CDS)全长序列,并利用生物信息学工具系统分析Bim蛋白的一级、二级和三级结构特征。多序列比对显示,团头鲂Bim蛋白与红鳍鲌(Chanodichthys erythropterus)的同源性最高(98.34%),基于邻接法(Neighbor-Joining)构建的系统进化树进一步支持两者在进化上具有最近亲缘关系。组织表达谱分析表明,bim基因及其潜在调控因子mam-miR-24-3在鳃组织中表达量显著高于其他组织;在低氧胁迫24h后,两者在鳃中的表达均显著上调,提示其可能协同参与团头鲂鳃组织的低氧应答过程。通过双荧光素酶报告基因实验证实,mam-miR-24-3可直接靶向结合bim mRNA的3′非翻译区(3′-UTR),导致荧光素酶活性下降,结合绿色荧光蛋白技术的共定位分析,表明mam-miR-24-3可在转录后水平负调控bim表达。亚细胞定位实验显示,在常氧与低氧条件下,Bim蛋白均主要定位于细胞核,提示其可能通过核内信号通路直接调控下游基因转录。研究为揭示bim基因在团头鲂低氧适应中的分子机制提供了理论依据,并为团头鲂耐低氧育种靶点的筛选奠定基础。
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关键词
bim
mam-miR-24-3
鳃
生物信息学分析
低氧
团头鲂
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题名
团头鲂bim基因的分子特征、组织表达及其与mam-miR-24-3的关系验证
1
作者
丁思玉
冯雅慧
LOIC Kemmadzong Foning
陈杰
郑国栋
邹曙明
机构
上海海洋大学农业农村部团头鲂遗传育种中心
出处
《水生生物学报》
2025年第10期126-134,共9页
基金
国家重点研发计划(2022YFD2400600-2)
国家自然科学基金(32273100)资助。
文摘
为了明确团头鲂(Megalobrama amblycephala)bim基因的结构和功能,研究通过TA克隆获得其编码区(CDS)全长序列,并利用生物信息学工具系统分析Bim蛋白的一级、二级和三级结构特征。多序列比对显示,团头鲂Bim蛋白与红鳍鲌(Chanodichthys erythropterus)的同源性最高(98.34%),基于邻接法(Neighbor-Joining)构建的系统进化树进一步支持两者在进化上具有最近亲缘关系。组织表达谱分析表明,bim基因及其潜在调控因子mam-miR-24-3在鳃组织中表达量显著高于其他组织;在低氧胁迫24h后,两者在鳃中的表达均显著上调,提示其可能协同参与团头鲂鳃组织的低氧应答过程。通过双荧光素酶报告基因实验证实,mam-miR-24-3可直接靶向结合bim mRNA的3′非翻译区(3′-UTR),导致荧光素酶活性下降,结合绿色荧光蛋白技术的共定位分析,表明mam-miR-24-3可在转录后水平负调控bim表达。亚细胞定位实验显示,在常氧与低氧条件下,Bim蛋白均主要定位于细胞核,提示其可能通过核内信号通路直接调控下游基因转录。研究为揭示bim基因在团头鲂低氧适应中的分子机制提供了理论依据,并为团头鲂耐低氧育种靶点的筛选奠定基础。
关键词
bim
mam-miR-24-3
鳃
生物信息学分析
低氧
团头鲂
Keywords
bim
mam-miR-24-3
Gill
Bioinformatics analysis
Hypoxia
Megalobrama amblycephala
分类号
Q344.1 [生物学]
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作者
出处
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1
团头鲂bim基因的分子特征、组织表达及其与mam-miR-24-3的关系验证
丁思玉
冯雅慧
LOIC Kemmadzong Foning
陈杰
郑国栋
邹曙明
《水生生物学报》
2025
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