cDNA末端快速扩增技术及其方法的改进 被引量：2

1

作者 贺斌 黄兴奇 +4 位作者 余腾琼 钟巧芳 王玲仙 张秀 程在全 《浙江农业科学》 2012年第9期1352-1357,共6页

cDNA末端快速扩增(RACE)技术可以快速扩增mRNA3'和5'末端,从而获得全长的cDNA序列,为分离和研究新的基因提供了一个快速简便的方法。从RACE的原理出发,综述RACE技术的优缺点,阐述RACE技术的改良,并对其应用现状和发展前景进行... cDNA末端快速扩增(RACE)技术可以快速扩增mRNA3'和5'末端,从而获得全长的cDNA序列,为分离和研究新的基因提供了一个快速简便的方法。从RACE的原理出发,综述RACE技术的优缺点,阐述RACE技术的改良,并对其应用现状和发展前景进行了分析。 展开更多

关键词 cdna末端快速扩增 race原理 race的优化 TdT加尾 RLM-race

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反向嵌套PCR法高效扩增辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA5′末端序列 被引量：8

2

作者 李秋莉 高晓蓉 +3 位作者 范琦 袁晓东 刘大伟 安利佳 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2001年第11期17-19,共3页

采用反向嵌套PCR法 ,根据已获得的辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA的部分序列 ,设计一条 5′末端磷酸化的特异性反转录引物和两对特异性反向嵌套PCR引物 ,成功地克隆了辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA 5′末端。与锚定PCR法相比 ,反向嵌套PCR法... 采用反向嵌套PCR法 ,根据已获得的辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA的部分序列 ,设计一条 5′末端磷酸化的特异性反转录引物和两对特异性反向嵌套PCR引物 ,成功地克隆了辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA 5′末端。与锚定PCR法相比 ,反向嵌套PCR法具有特异性强、扩增效率高等优点 ,是一种非常有效的扩增cDNA 5′末端序列的方法。 展开更多

关键词 反向嵌套PCR 辽宁碱蓬 甜菜碱醛脱氢酶 5′cdna 末端序列 基因工程 race 反转录 克隆 扩增效率

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克隆全长cDNA的方法及其在兽药研究中的应用 被引量：2

3

作者 谢馥交 卢向阳 《中国兽药杂志》 2006年第5期39-43,共5页

综述了获取基因全长cDNA序列的方法,即全长cDNA文库的构建、cDNA末端快速扩增和电子克隆;重点介绍了O ligo-capping、CAPture、Cap-trapper及SMART构建全长cDNA文库的方法,并阐述了其在兽药研究中的应用。

关键词 全长cdna 全长cdna文库 cdna末端快速扩增 电子克隆

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高山红景天中糖基转移酶家族cDNA全长基因的克隆 被引量：3

4

作者 于寒松 张继星 +2 位作者 李彦舫 马兰青 胡耀辉 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第21期244-247,共4页

为了获得高山红景天中红景天苷生物合成关键酶——UDP-糖基转移酶家族基因的全长cDNA序列,采用在线简并引物设计软件结合3′-RACE技术获得两个糖基转移酶基因的3′端部分序列,进一步采用不同的5′-RACE试剂盒扩增两个基因的5′端序列,... 为了获得高山红景天中红景天苷生物合成关键酶——UDP-糖基转移酶家族基因的全长cDNA序列,采用在线简并引物设计软件结合3′-RACE技术获得两个糖基转移酶基因的3′端部分序列,进一步采用不同的5′-RACE试剂盒扩增两个基因的5′端序列,结果显示利用Takara公司的试剂盒扩增可以得到cDNA全长序列(GenBank登录号为EF508689和EU567325),而采用Invitrogen公司的试剂盒得到的序列不包括全部开放读码框。实验证明,利用Takara公司的SMARTerTM RACE cDNA Amplification Kit克隆获得基因全长序列的比率更高。 展开更多

关键词 糖基转移酶 基因克隆 cdna末端快速克隆法(race) 高山红景天

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猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析 被引量：7

5

作者 梅盈洁 李加琪 +5 位作者 陈瑶生 李晓筠 朱良瑞 凌飞 王翀 张豪 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期432-436,共5页

以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长（GenBank登录号为DQ018727）,猪CTSD基因cDNA... 以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长（GenBank登录号为DQ018727）,猪CTSD基因cDNA全长2032 bp包括93 bp 5′UTR区、706 bp 3′UTR区和1 233bp ORF,编码410个氨基酸残基。其编码区与人、鼠、牛、羊CTSD编码区同源性分别为87.9%、78.2%、86.6%和85.0%,其氨基酸序列与人、鼠、牛、羊氨基酸序列同源性分别为86.6%、80.1%、86.0%和84.7%。疏水性分析和信号肽预测发现猪CTSD氨基酸序列存在至少7个疏水性区域,信号肽位点为第1-20个氨基酸残基。在NCBI进行Blast P搜索结果显示猪CTSD氨基酸结构中含有Asn（Asparagine,天门冬酰胺）结构域,与天冬氨酸蛋白酶3D结构同源性高达99.7%,具有真核生物天冬氨酸蛋白酶的典型结构。以猪多组织RNA池为模板,以1026 bp部分cDNA序列作为杂交探针进行Northern杂交,得到一条2000 bp左右特异条带,从而验证了RACE产物为全长cDNA并揭示该基因只有一个转录本。为了研究猪CTSD基因在体内不同组织内表达的特点,采用半定量RT-PCR对CTSD基因在猪10个组织中的表达进行研究,结果表明在10个组织中均有表达,且表达量与-βactin内参接近。 展开更多

关键词 猪 溶酶体组织蛋白酶D 电子克隆 快速扩增cdna末端 全长cdna

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猪类无精症缺失基因DAZL的cDNA全长克隆、组织表达和亚细胞定位 被引量：3

6

作者 王配 王丽娜 +4 位作者 霍海龙 张霞 赵筱 王雪飞 霍金龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期683-692,共10页

旨在获得猪类无精症缺失基因DAZL cDNA全长序列,阐明该基因的序列、mRNA组织表达模式、蛋白质结构特征及亚细胞定位情况。本研究以版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)10月龄成年公猪为研究对象,屠宰收集组织样,利用RACE... 旨在获得猪类无精症缺失基因DAZL cDNA全长序列,阐明该基因的序列、mRNA组织表达模式、蛋白质结构特征及亚细胞定位情况。本研究以版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)10月龄成年公猪为研究对象,屠宰收集组织样,利用RACE和RT-PCR技术获得DAZL基因cDNA全长序列;使用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测其mRNA多组织表达谱;在线分析蛋白质的结构特点和保守结构域;用体外细胞转染技术鉴定其在ST猪睾丸细胞中的定位。结果表明,BMI DAZL cDNA全长2985 bp(KU705632),包含888 bp的CDS区,编码295个氨基酸(AOC89050);该基因位于猪13号染色体,含11个外显子。qPCR结果显示,DAZL mRNA在睾丸中特异高表达。生物信息学分析表明,猪DAZL蛋白含有哺乳动物RMP和DAZ同源区,无规则卷曲在二级结构中超过50%。进化分析表明,BMI DAZL氨基酸序列高度保守,与牛科的亲缘关系最为接近。pEGFP-C1-DAZL转染ST细胞后的荧光共定位结果显示,DAZL蛋白主要分布在细胞核中。本研究分别从DNA、mRNA和蛋白质层面阐明了BMI DAZL基因的序列特征、表达、蛋白质结构和定位,为进一步研究DAZL在BMI精子发生方面的功能奠定基础。 展开更多

关键词 版纳微型猪近交系 类无精症缺失基因(DAZL) 基因克隆 cdna末端快速克隆(race) 组织表达 亚细胞定位

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人UCA1基因新剪接变异体全长cDNA序列的克隆 被引量：4

7

作者 王宇 陈葳 李旭 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期11-13,28,共4页

目的克隆新的UCA1剪接变异体全长cDNA序列,为研究其可变剪接机制奠定基础。方法用电子克隆技术和cDNA序列末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增细胞系BLZ-211cDNA并进行产物测序和序列拼接。结果新克隆的UCA1... 目的克隆新的UCA1剪接变异体全长cDNA序列,为研究其可变剪接机制奠定基础。方法用电子克隆技术和cDNA序列末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增细胞系BLZ-211cDNA并进行产物测序和序列拼接。结果新克隆的UCA1剪接变异体全长cDNA序列为2 202bp。结论综合采用电子克隆技术与RACE技术是获得全长cDNA序列的有效方法,为该基因的后续可变剪接机制的研究奠定了基础。 展开更多

关键词 uca1 电子克隆 cdna末端快速扩增技术

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大黄鱼α-珠蛋白cDNA的克隆及其特性分析 被引量：5

8

作者 褚武英 于涟 +2 位作者 毛芝娟 张崇文 钱荣华 《科技通报》 2005年第6期674-678,共5页

采用3'末端快速扩增法,首次从大黄鱼中克隆到564bp的血红蛋白α亚基cDNA。该序列包含435bp的开放读码框和126bp的3'末端非编码区,编码144个氨基酸的多肽。计算其可能的相对分子质量为15 930D,等电点为9.27,推导的氨基酸序列与其... 采用3'末端快速扩增法,首次从大黄鱼中克隆到564bp的血红蛋白α亚基cDNA。该序列包含435bp的开放读码框和126bp的3'末端非编码区,编码144个氨基酸的多肽。计算其可能的相对分子质量为15 930D,等电点为9.27,推导的氨基酸序列与其它13种鱼及人血红蛋白α亚基进行同源性比较,其同源性在35.7%￣70.3%之间,它与同属真口鱼纲的草鱼、大西洋鲑鱼、金鱼、虹鳟、金枪鱼、电鳗等的同源性较高,而与肉鳍鱼纲的肺鱼及板鳃纲的鲨鱼的同源性较低,而且发现该序列在CD5(第48位)处插入了一个独特的甘氨酸残基,在近端与血红素结合的F8(第90位)的组氨酸高度保守。 展开更多

关键词 大黄鱼 珠蛋白 末端快速扩增法 克隆

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牙鲆T细胞抗原受体(TCR)β链同源cDNA的克隆 被引量：1

9

作者 乌日琴 张培军 +2 位作者 李军 徐芃 徐永立 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第4期85-91,共7页

从牙鲆外周血淋巴细胞cDNA文库中克隆TCRβ1319bp同源cDNA序列并对其基因结构进行生物信息学分析。RT-PCR其编码区为942bp,编码314个氨基酸,编码区包括V、D、J和C区4个基因片段。TCRVβ片段主要包括从21～115位氨基酸残基的95个氨基酸序... 从牙鲆外周血淋巴细胞cDNA文库中克隆TCRβ1319bp同源cDNA序列并对其基因结构进行生物信息学分析。RT-PCR其编码区为942bp,编码314个氨基酸,编码区包括V、D、J和C区4个基因片段。TCRVβ片段主要包括从21～115位氨基酸残基的95个氨基酸序列,Jβ区与哺乳动物的Jβ区高度保守,在位于Vβ和Jβ之间的Dβ区中没有发现8碱基保守序列(GGACAGGG),CDR3β氨基酸序列为GTRILYE。牙鲆TCRCβ片段共有179个氨基酸残基,缺失位于Cβ细胞外区和临近区域的2个5～9氨基酸弹性区域。牙鲆TCRCβ片段的铰链区有6个氨基酸残基,缺少半胱氨酸位点,含Lys271保守位点。经RT-PCR检测,在脾、外周血和前肾中都发现TCRβ的表达,肌肉和肝中均未克隆到目的片段。 展开更多

关键词 牙鲆 T细胞抗原受体β链 TCR-β基因 cdna末端快速扩增方法 T细胞受体 克隆 鱼类免疫学 疾病治疗

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茶树八氢番茄红素脱氢酶cDNA全长克隆与表达分析 被引量：3

10

作者 李娜娜 邵文韵 +2 位作者 刘畅 陆建良 梁月荣 《茶叶》 2014年第2期69-74,共6页

八氢番茄红素脱氢酶是类胡萝卜素生物合成途径的关键酶之一。本实验采用3'/5'RACE和RTPCR技术成功扩增出茶树八氢番茄红素脱氢酶基因(PDS)的3'端和5'端序列,序列拼接获得全长cDNA序列,命名为CsPDS,并将其登录至GenBank... 八氢番茄红素脱氢酶是类胡萝卜素生物合成途径的关键酶之一。本实验采用3'/5'RACE和RTPCR技术成功扩增出茶树八氢番茄红素脱氢酶基因(PDS)的3'端和5'端序列,序列拼接获得全长cDNA序列,命名为CsPDS,并将其登录至GenBank,登录号KF646537。经生物信息学分析,所得基因cDNA序列全长为2295 bp,开放阅读框(ORF)1749 bp,编码582个氨基酸,预测分子量约为64.86 kDa,理论等电点(PI)为6.77,属于亲水性蛋白。该基因编码的氨基酸序列与柿树PDS序列的同源性达到87%,多序列比对表明茶树PDS具有高度保守区域,基于邻接法的进化树显示与柿树、葡萄的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析结果显示,CsPDS在‘黄金芽’体内表达没有受抑制,表明‘黄金芽’黄色白化可能不是在CsPDS基因转录水平异常而引起。 展开更多

关键词 茶树 八氢番茄红素脱氢酶 cdna末端快速克隆 序列分析 表达分析

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广东紫菜Hsp70基因cDNA克隆与表达分析

11

作者 曾俊 陈伟洲 +1 位作者 陈泽攀 刘浩然 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第4期131-139,共9页

为探索广东紫菜(Pyropia guangdongensis)叶状体Hsp70基因在温度刺激下机体耐温相关分子机制,为广东紫菜的栽培生产提供技术参考,本研究利用RACE技术获得了广东紫菜Hsp70基因(PgHsp70)全长序列,并在此基础上采用实时荧光定量PCR技术,研... 为探索广东紫菜(Pyropia guangdongensis)叶状体Hsp70基因在温度刺激下机体耐温相关分子机制,为广东紫菜的栽培生产提供技术参考,本研究利用RACE技术获得了广东紫菜Hsp70基因(PgHsp70)全长序列,并在此基础上采用实时荧光定量PCR技术,研究广东紫菜叶状体分别在不同温度(22℃、27℃和31℃)条件下处理0、1/6、1/2、1、6、12、24和36h后PgHsp70基因的差异表达。结果显示,PgHsp70基因序列长2004bp,包含一个1866bp的开放阅读框,可编码621个氨基酸,预测分子量为67.7kDa,理论等电点为4.87。基因表达水平定量分析表明,温度对PgHsp70基因表达水平有显著影响,PgHsp70基因在不同温度的表达水平变化趋势基本一致,均呈现先上调后下降的趋势,且均于1 h表达量到达最高水平,其中,在31℃ 1h表达量最高,为未经高温处理组的11倍,说明PgHsp70基因在应答高温胁迫中发挥着重要的作用。 展开更多

关键词 广东紫菜 高温胁迫 HSP70 cdna末端快速扩增技术(race) QRT-PCR

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cDNA文库构建策略及其分析研究进展 被引量：81

12

作者 晏慧君 黄兴奇 程在全 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第1期1-6,共6页

cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从... cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从而克隆cDNA全长;对文库进行均一化处理即均一化cDNA文库,可以增加克隆低丰度mRNA的机会;差减cDNA文库在研究生物体某一时期基因差异表达上具有重要的意义;改进的固相cDNA很大程度上提高了建库的效率和质量。本文以阐述基本原理为主,介绍几种近年来常用的cDNA构建的方法及其优缺点。 展开更多

关键词 cdna文库 cdna全长 基因克隆 均一化cdna文库 差减cdna文库 固相cdna文库 快速扩增cdna末端(race)

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盐芥ThNHX1基因的3′RACE 被引量：5

13

作者 蔡小宁 杨平 +2 位作者 贲爱玲 沈志花 王敏 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第21期5485-5486,5524,共3页

以盐芥为材料,依据拟南芥AtNHX1基因的序列信息设计引物,扩增出盐芥中ThNHX1基因的部分序列,然后使用快速扩增cDNA3′末端(3′RACE)方法,从盐芥中克隆到ThNHX13′cDNA序列。该序列全长680 bp,编码104个氨基酸,其编码序列、氨基酸序列与... 以盐芥为材料,依据拟南芥AtNHX1基因的序列信息设计引物,扩增出盐芥中ThNHX1基因的部分序列,然后使用快速扩增cDNA3′末端(3′RACE)方法,从盐芥中克隆到ThNHX13′cDNA序列。该序列全长680 bp,编码104个氨基酸,其编码序列、氨基酸序列与拟南芥AtNHX1基因的相应序列同源性分别为91%和91.5%,而盐芥ThNHX1基因3′端非翻译区序列与拟南芥相应序列的同源性为68.5%,明显低于编码区。 展开更多

关键词 盐芥 ThNHX1基因 克隆 快速扩增cdna3’末端

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中国荷斯坦奶牛铁蛋白基因3′端克隆及序列分析

14

作者 罗佳捷 彭瑛 +5 位作者 罗锐 张彬 李丽立 吴力专 占今舜 邢月腾 《草业学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期96-103,共8页

本研究旨在克隆和分析中国荷斯坦奶牛的铁蛋白(FTH)基因,为该基因的功能研究和有效利用提供理论依据。运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从公犊肝脏组织中扩增出FTH基因的3′端cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因的氨基酸序列进行分... 本研究旨在克隆和分析中国荷斯坦奶牛的铁蛋白(FTH)基因,为该基因的功能研究和有效利用提供理论依据。运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从公犊肝脏组织中扩增出FTH基因的3′端cDNA序列,并利用生物信息学方法对该基因的氨基酸序列进行分析。结果表明,FTH基因3′端cDNA全长为489bp,编码81个氨基酸;经生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白无N端信号肽及跨膜区,相对分子质量为9.125 3kD,理论等电点为5.19,脂肪系数为85.56,总亲水性为-0.342,其一级结构中存在4个功能结构域;二级结构元件以α-螺旋和β-旋转为主;同源序列分析表明,中国荷斯坦奶牛与原牛FTH氨基酸的相似性最高(99%);系统进化树显示,在该基因座位上中国荷斯坦奶牛与所测物种的亲缘关系均较远。本研究有助于揭示FTH家族基因的进化历史,为对其进行深入的功能分析和利用研究提供参考。 展开更多

关键词 中国荷斯坦奶牛 铁蛋白 cdna末端快速扩增 克隆 序列分析

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山核桃水通道蛋白CcPIP同源基因克隆与表达分析 被引量：1

15

作者 艾雪 褚怀亮 +3 位作者 李雪芹 黄坚钦 江敏利 郑炳松 《福建林学院学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期252-257,共6页

利用RACE方法,在山核桃嫁接过程中扩增出山核桃水通道蛋白同源基因CcPIP。应用生物信息学软件进行分析,预测该序列编码294个氨基酸,具有6个跨膜区,有MIP家族信号序列和高等植物PIP高度保守序列。通过NCBI同源性比较分析表明,该基因与葡... 利用RACE方法,在山核桃嫁接过程中扩增出山核桃水通道蛋白同源基因CcPIP。应用生物信息学软件进行分析,预测该序列编码294个氨基酸,具有6个跨膜区,有MIP家族信号序列和高等植物PIP高度保守序列。通过NCBI同源性比较分析表明,该基因与葡萄、菜豆等物种的水通道蛋白基因同源性达到99%。荧光定量RT-PCR分析表明,CcPIP基因在芽中的表达量最低,其次是雄花序,果实,幼叶和茎,而在根中表达量最高。在山核桃嫁接前后,CcPIP基因在接穗中表达趋势和在砧木中的表达一致。CcPIP基因的表达量在山核桃嫁接前砧木和接穗中都有强烈表达,但在嫁接后3 d急剧下降,分别在砧木和接穗中下降了5倍和2倍。在随后的11 d里,CcPIP基因的表达量在砧木和接穗中开始上升,至嫁接后14 d基因的转录水平比嫁接后3 d分别增加了7倍和4倍。该CcPIP基因参与山核桃嫁接成活的水分运输过程中起到基因表达调控的作用。 展开更多

关键词 山核桃 水通道蛋白CcPIP cdna末端快速扩增(rapidam plification of cdna ends race) 定量RT-PCR

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大黄鱼凝血酶原类似基因的克隆及其表达分析

16

作者 卫玮 吴海珍 +2 位作者 徐红艳 常抗美 张元兴 《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期48-53,共6页

采用快速末端cDNA扩增法，首次从大黄鱼中克隆到全长为2023bp的凝血酶原类似基因cDNA，编码为617个氨基酸，其中包括80bp的5’末端非编码区及89bp包含poly（A）尾的3’末端非编码区。预测1～15位的氨基酸处存在1个信号肽。推导的氨基酸... 采用快速末端cDNA扩增法，首次从大黄鱼中克隆到全长为2023bp的凝血酶原类似基因cDNA，编码为617个氨基酸，其中包括80bp的5’末端非编码区及89bp包含poly（A）尾的3’末端非编码区。预测1～15位的氨基酸处存在1个信号肽。推导的氨基酸序列与哺乳动物及其他鱼类进行同源性比较，发现其与红鳍东方纯有73％同源性，而与哺乳动物的同源性为50％～65％。凝血酶原类似基因虽然在大黄鱼的各个组织中组成型表达，但是在减毒鳗弧菌免疫的大黄鱼的脾脏和肾脏中表达明显上调，这表明凝血酶可能参与大黄鱼对细菌侵染的免疫应答。 展开更多

关键词 大黄鱼 凝血酶原类似基因 鳗弧菌 快速末端cdna扩增法

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水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析

17

作者 王步勇 王峰 +3 位作者 李丹蕾 马玲 陈俏丽 王博文 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期305-311,共7页

根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术（RACE法）从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC（NCBI登录号为KT188820）。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框（ORF）。... 根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术（RACE法）从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC（NCBI登录号为KT188820）。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框（ORF）。预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白。保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族。多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY（XP_001891979.1）蛋白的相似度为43%。蛋白结构分析结果表明,β–折叠与无规则卷曲是Ab–SPRYSEC蛋白的主要结构元件。表达定位分析结果表明,Ab–SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab–SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。 展开更多

关键词 水稻干尖线虫 SPRYSEC基因 原位杂交 c DNA末端快速扩增技术(race法)

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