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大豆SSR指纹图谱身份证的研究进展与展望 被引量：14
1
作者 陈亮 郑宇宏 +5 位作者 范旭红 孟凡凡 孙星邈 张云峰 王明亮 王曙明 《大豆科技》 2015年第2期38-43,共6页
随着新育成大豆品种数量的不断增加以及分子生物学技术的发展,指纹图谱身份证的构建逐渐成为当今品种鉴定的重要技术手段。文中综述了SSR指纹图谱身份证技术在大豆品种鉴定方面的应用进展;综合分析了当前SSR指纹图谱身份证构建技术存在... 随着新育成大豆品种数量的不断增加以及分子生物学技术的发展,指纹图谱身份证的构建逐渐成为当今品种鉴定的重要技术手段。文中综述了SSR指纹图谱身份证技术在大豆品种鉴定方面的应用进展;综合分析了当前SSR指纹图谱身份证构建技术存在的问题,并提出相应的改进方向,以期为科学快速准确地鉴定大豆品种,评价种质资源和解决品种产权纠纷提供参考依据。 展开更多
关键词 大豆 ssr指纹图谱身份证 进展
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基于SSR分子标记的紫椴遗传多样性分析和指纹图谱构建
2
作者 高磊 刘丹 《北京林业大学学报》 北大核心 2025年第3期28-37,共10页
【目的】紫椴是重要的经济树种和国家重点保护的濒危树种,基于SSR分子标记,分析不同种源紫椴遗传多样性,构建指纹图谱,旨在为紫椴居群的保护、全国紫椴种质资源的收集保存以及资源库建设提供参照。【方法】从国内5个省11个市采集16个种... 【目的】紫椴是重要的经济树种和国家重点保护的濒危树种,基于SSR分子标记,分析不同种源紫椴遗传多样性,构建指纹图谱,旨在为紫椴居群的保护、全国紫椴种质资源的收集保存以及资源库建设提供参照。【方法】从国内5个省11个市采集16个种源的173份紫椴样品,采用SSR分子标记进行PCR扩增,分析紫椴的遗传多样性;利用分子方差分析和种群聚类分析探究居群间的遗传分化;根据筛选的引物构建紫椴的指纹图谱。【结果】(1)从12组引物中筛选出了8组表现出高度多态性和良好重复性的引物,这些引物总共识别出101个等位基因,平均每个多态性位点上分布有12.6个等位基因。多态信息含量在不同位点间的变动区间为0.506~0.897,平均值达到0.739。(2)仅需4对引物(C110、C840、D150、TC5)即可有效区分所有紫椴个体,并构建紫椴指纹图谱。(3)紫椴种源的遗传多样性较为丰富,有效等位基因数为4.937,Shannon’s信息指数达到1.777,Nei’s基因多样性则为0.771。(4)分子方差分析结果表明,91%的遗传变异来源于紫椴群体内。(5)根据遗传距离构建进化树,将16个种源划分为5个亚类,多数地理距离较近的种源聚到一起,表现出较相近的遗传关系。【结论】紫椴群体总体遗传多样性水平较高,遗传分化处于中等水平,群体内遗传变异占主导地位。16个居群中,吉林省汪清种源(JWQ3)、黑龙江种源(HDN7、HDN8、HDN9)和河北承德市种源(HCD15)遗传多样性水平低,应进行原地保护,重点持续关注;种群JWQ2、JWQ4、JHL5、HNA10、LDD12和LFX13等的遗传多样性水平较高,可重点收集资源和保存培育。研究结果为深入研究中国紫椴的居群分布、进化和保护提供科学依据。 展开更多
关键词 紫椴 ssr标记 遗传多样性 遗传分化 DNA指纹图谱 聚类分析
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基于SSR标记的石榴良种遗传多样性分析及指纹图谱构建
3
作者 王瑞雪 于晓燕 +4 位作者 王浩然 吴其超 马燕 臧德奎 臧凤岐 《北京农学院学报》 2025年第2期34-40,共7页
【目的】分析山东省内石榴良种的遗传背景并构建其指纹图谱,以期为后期石榴品种的选育和鉴定等方面提供分子层面支持。【方法】以18份石榴良种样品为材料,利用8对荧光SSR引物进行遗传分析,并构建指纹图谱。【结果】共检测到31个等位基因... 【目的】分析山东省内石榴良种的遗传背景并构建其指纹图谱,以期为后期石榴品种的选育和鉴定等方面提供分子层面支持。【方法】以18份石榴良种样品为材料,利用8对荧光SSR引物进行遗传分析,并构建指纹图谱。【结果】共检测到31个等位基因(Na),平均每对引物3.875个。PIC最小值为0.372,最大值为0.618,平均值为0.501;Shannon信息指数(I)范围在0.687~1.283,平均值为1.009。Nei’s遗传距离变化范围为0.065~2.007,变幅为1.942,遗传相似系数为0.135~0.964,变幅0.829。筛选出5对核心引物,可分为Pu04+Pu16+Pu17,Pu05+Pu16+Pu17两组,每组均可完全区分18个石榴良种。以5对核心引物生成分子指纹特征码,并构建指纹图谱。【结论】利用SSR标记构建石榴良种分子身份证操作简便可行,可为石榴品种真伪鉴定、权益保护、身份识别、溯源管理及新品种选育提供技术支撑和科学依据。 展开更多
关键词 石榴 遗传多样性 指纹图谱 ssr
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梨品种SSR特征指纹图谱与分子身份证构建 被引量：14
4
作者 薛华柏 赵瑞娟 +5 位作者 王磊 杨健 王龙 王苏珂 苏艳丽 李秀根 《中国南方果树》 北大核心 2018年第S1期42-49,97,共9页
为了加强对梨种质资源和育成品种的管理,便于对相关材料进行区分鉴定、资源交换以及新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,利用筛选的25对SSR核心引物对分别属于沙梨、白梨、新疆梨、西洋梨和秋子梨的共124个梨品种进行扩增,构建梨品... 为了加强对梨种质资源和育成品种的管理,便于对相关材料进行区分鉴定、资源交换以及新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,利用筛选的25对SSR核心引物对分别属于沙梨、白梨、新疆梨、西洋梨和秋子梨的共124个梨品种进行扩增,构建梨品种SSR特征指纹数据表,再将各品种在数据表中各SSR位点的基因型数据进行排序和赋值,串联赋值字符生成124个梨品种的SSR分子身份证号码。结果表明,25对引物表现了较强的品种区分能力,仅用其中9对引物(Pb2L5N03978、Pb4L11N0673、Pb2L2N01186、Pb2L11N19979、Pb2LUN24633、Pb2L2N00685、Pb3L8N5448、Pb3L5N1095、Pb3LUN6569)即可区分115份梨品种;但25对引物未能将'张掖长把'和'兰州长把','巍山红雪梨1号'和'巍山红雪梨2号','火把梨''晚熟火把梨'和'祥云火把梨','弥渡小红梨'和'祥云小红梨'等4组共9个品种区分开。利用优选排序的上述9对引物位点及Pb2LUN23926引物位点的基因型数据构建了供试124个梨品种的SSR特征指纹数据表,生成了SSR分子身份证号码。本研究提供了一个在梨品种SSR特征指纹数据表的基础上,对基因型数据进行编号生成梨品种SSR分子身份证号码的新方法。 展开更多
关键词 梨 ssr 指纹图谱 分子身份证 特征指纹数据表
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谷子新品种陇谷23号选育及SSR指纹图谱
5
作者 刘天鹏 何继红 +6 位作者 董孔军 任瑞玉 张磊 康继平 郭丹 李亚伟 杨天育 《寒旱农业科学》 2024年第12期1097-1102,共6页
谷子作为我国北方地区的特色作物之一,多数育种方式仍采用常规育种结合少数分子辅助选择育种,构建指纹图谱是分子育种中组成部分,对于品种特征标识和真实性鉴定有着重要的意义。陇谷23号是豫谷1号×陇谷7号杂交后代经系统选育的优... 谷子作为我国北方地区的特色作物之一,多数育种方式仍采用常规育种结合少数分子辅助选择育种,构建指纹图谱是分子育种中组成部分,对于品种特征标识和真实性鉴定有着重要的意义。陇谷23号是豫谷1号×陇谷7号杂交后代经系统选育的优质、丰产谷子新品种。2020年参加全国区域试验西北春谷早熟区组的区域适应性联合鉴定试验,7个试点平均折合产量为5446.0kg/hm^(2),增产点率为57.14%。在2020年参加的甘肃省谷子生产试验中,8点(次)均表现增产,平均折合产量为4537.5kg/hm^(2),较对照品种豫谷18号增产2.08%~36.84%。籽粒含粗蛋白(干基)125.7g/kg、粗脂肪(干基)38.2g/kg、粗淀粉(干基)794.5g/kg、赖氨酸(干基)1.8g/kg、支链淀粉(占淀粉)784g/kg。抗谷锈病、黑穗病,中抗谷瘟病、白发病和玉米螟,适宜在甘肃中东部、山西大同、陕西榆林、宁夏固原及内蒙古呼和浩特等西北春谷区种植。利用(豫谷1号×陇谷7号)F_(2)、RIL群体构建的连锁图谱中的74对多态性SSR标记绘制了陇谷23号9条染色体的指纹图谱,其中49对SSR与豫谷1号基因型相同、25对SSR与陇谷7号基因型相同,表明陇谷23号携带更多豫谷1号基因组组分。 展开更多
关键词 谷子 新品种 陇谷23号 选育 指纹图谱 ssr标记
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基于SSR构建中国主栽草莓品种指纹图谱 被引量：1
6
作者 蔡露莹 刘松 +6 位作者 聂兴华 杨海清 曹庆芹 李虎臣 肖婷婷 李日俭 张卿 《北京农学院学报》 2024年第1期7-12,共6页
【目的】利用SSR分子标记构建中国主栽草莓品种的DNA指纹图谱,为保护育种者权益和实现草莓资源的高效鉴定提供基础数据。【方法】以中国目前主栽的草莓品种(70个)为材料,采用荧光毛细管电泳技术对28个SSR分子标记进行评估,利用筛选后的... 【目的】利用SSR分子标记构建中国主栽草莓品种的DNA指纹图谱,为保护育种者权益和实现草莓资源的高效鉴定提供基础数据。【方法】以中国目前主栽的草莓品种(70个)为材料,采用荧光毛细管电泳技术对28个SSR分子标记进行评估,利用筛选后的高效SSR标记构建草莓品种的DNA指纹图谱。【结果】从28对引物中选出了5对多态性较高、重复性较好的核心引物。核心引物共检测出40个等位位点,平均每对引物检测出8个等位位点;共检测到142个带型,平均每对引物检测出28.4个带型;各标记的多态信息含量(PIC)为0.79~0.87,平均PIC值为0.83;聚类分析结果表明,草莓品种之间的相似系数范围为0.65~0.97。【结论】成功构建了具有唯一对应关系的70个草莓品种的DNA指纹图谱,为未来草莓品种的资源保护和利用推广提供数据支撑。 展开更多
关键词 ssr 指纹图谱 草莓品种鉴定 毛细管电泳
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SRAP和SSR标记构建的甘蓝型油菜品种指纹图谱比较 被引量：47
7
作者 文雁成 王汉中 +1 位作者 沈金雄 刘贵华 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期233-239,共7页
利用SRAP(sequence-related amp lified polymorph ism)和SSR标记构建了甘蓝型油菜品种指纹图谱,并对两种标记方法进行了比较。结果表明:(1)每对SRAP引物扩增出20.36个条带,其中4.44个是清晰、易于辩认的多态性带;每对SSR引物扩增出3.8... 利用SRAP(sequence-related amp lified polymorph ism)和SSR标记构建了甘蓝型油菜品种指纹图谱,并对两种标记方法进行了比较。结果表明:(1)每对SRAP引物扩增出20.36个条带,其中4.44个是清晰、易于辩认的多态性带;每对SSR引物扩增出3.88个条带,均为多态性条带。(2)采用25对SRAP和SSR引物分别构建40个和75个品种的特异指纹图谱,SRAP指纹中具有特异图谱的比例(82.5%和50.7%)高于SSR指纹图谱的结果(60.0%和44.4%)。品种数越多具有特异指纹的品种越少。(3)运用引物组合法构建品种指纹图谱,大大地提高了指纹图谱的特异性。25对SSR引物组合扩增97个多态性谱带,两个不同的品种具有相同谱带的概率只有6.3108×10-30。组合指纹图谱比组合数码图谱更直观。与SRAP标记相比,SSR标记以其扩增谱带少、易于识别和统计而更适合用于引物组合法构建品种指纹图谱。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 品种 指纹图谱 SRAP标记 ssr标记
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结缕草属优良品系SSR指纹图谱的构建 被引量：49
8
作者 郭海林 刘建秀 +2 位作者 高鹤 何秋 胡化广 《草业学报》 CSCD 2007年第2期53-59,共7页
采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合快速银染检测,从45对Xgwm系列SSR引物中筛选出2对产物清晰、稳定的引物,建立了11个结缕草优良品系的DNA指纹图谱,并借鉴常规植物分类法,以品系的特征带为依据,从分子的角度将它们与生产上的主栽品种‘... 采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合快速银染检测,从45对Xgwm系列SSR引物中筛选出2对产物清晰、稳定的引物,建立了11个结缕草优良品系的DNA指纹图谱,并借鉴常规植物分类法,以品系的特征带为依据,从分子的角度将它们与生产上的主栽品种‘马尼拉’、‘青岛结缕草’和‘兰引3号’结缕草区分开来。最后利用统计软件SPSS 10.0通过欧氏平方距离法进行聚类分析,将14份参试材料分为3组。 展开更多
关键词 结缕草 品系(种) ssr指纹图谱
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基于SSR标记的葡萄品种(系)遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量：15
9
作者 郭春苗 李宁 +5 位作者 周晓明 樊丁宇 谢辉 张付春 潘明启 卢春生 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2051-2058,共8页
【目的】对供试葡萄材料进行遗传多样性分析,构建其指纹图谱,为葡萄分类、种质鉴定和制干葡萄定向育种提供科学依据。【方法】利用SSR标记对新疆44个相对适宜制干葡萄(Vitis L.)品种(系)进行遗传多样性分析及指纹图谱构建。【结果】以52... 【目的】对供试葡萄材料进行遗传多样性分析,构建其指纹图谱,为葡萄分类、种质鉴定和制干葡萄定向育种提供科学依据。【方法】利用SSR标记对新疆44个相对适宜制干葡萄(Vitis L.)品种(系)进行遗传多样性分析及指纹图谱构建。【结果】以52对SSR引物对供试材料的基因组DNA进行PCR扩增,筛选出8对多态性高、谱带清晰的引物。共扩增出190条带,均为多态性条带,多态性百分率为100%。多态性信息含量指数(PIC)变幅为0.686 8~0.964 0,平均为0.908 4。UPGMA聚类分析表明,44份葡萄品种(系)间遗传相似系数的变异范围为0.63~0.92,在遗传相似系数0.654处,可将44份供试材料分为5个类群,在一定程度上反映了品种之间的亲缘关系。利用Vmc9a2.1、UDV-017、UDV-033和UDV-041等4条引物构建了品种DNA指纹图谱,可区分44个供试材料。【结论】SSR标记方法可分析供试材料的亲缘关系,利用筛选出的4种引物可构建其DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 葡萄 ssr标记 遗传多样性 聚类分析 指纹图谱
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97个山杏无性系的遗传多样性及SSR指纹图谱 被引量：15
10
作者 金玲 刘明国 +2 位作者 董胜君 吴月亮 张欣 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第7期51-61,共11页
【目的】山杏是北方半干旱地区重要的生态经济型树种,种质资源异常丰富,形态鉴定与分类难度大。利用SSR分子标记研究山杏优选无性系的遗传多样性并构建指纹图谱,以期为山杏种质鉴定提供科学依据。【方法】根据山杏简化基因组测序结果,合... 【目的】山杏是北方半干旱地区重要的生态经济型树种,种质资源异常丰富,形态鉴定与分类难度大。利用SSR分子标记研究山杏优选无性系的遗传多样性并构建指纹图谱,以期为山杏种质鉴定提供科学依据。【方法】根据山杏简化基因组测序结果,合成600对SSR引物,利用4个山杏无性系进行引物筛选,选出155对扩增条带清晰的引物,对97个山杏优选无性系进行PCR扩增。应用引物组合法构建指纹图谱,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。【结果】利用155对SSR引物对97个山杏无性系进行扩增,共扩增出933个等位基因,每个位点的等位基因数为3~11个,平均为6.019个;各位点的多态性信息含量(PIC)为0.476~0.885,平均值为0.681,具有较高的多态性。50个山杏无性系在59个位点上具有特异等位基因,89个无性系在131个位点上具有特异基因型。采用5对引物(L56、X47H、L79H、P40H和X47)的组合可区分全部97个无性系,构建了指纹图谱。对97个山杏无性系进行亲缘关系分析,无性系间的遗传相似系数变化范围为0.669~0.943,平均值为0.757;基于遗传相似系数进行聚类分析,将97个无性系分为5大类,第1大类和第2大类下又分为3个亚类,分类结果与无性系的来源区域有明显的相关性。【结论】从600对SSR引物中筛选出155对,其扩增位点多态性较高、重复性较好。发现89个山杏无性系具有特异基因型,其中50个既具有特异基因型也具有特异等位基因。应用引物组合法构建了基于5对SSR引物扩增位点的山杏无性系指纹图谱。供试山杏无性系遗传差异较小,亲缘关系较近。研究结果可为山杏种质鉴别提供科学依据,也为山杏的育种工作奠定基础。 展开更多
关键词 山杏 无性系 ssr 遗传多样性 指纹图谱
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贵州12个辣椒杂交种SSR标记指纹图谱的构建与分析 被引量：12
11
作者 何建文 杨文鹏 +3 位作者 姜虹 杨红 万文鹏 胡明文 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期769-774,共6页
从辣椒基因组的75个SSR标记中筛选出15个多态性较好的标记,用于构建12个辣椒杂交种的数字化指纹图谱。在构建指纹图谱的基础上,用每个标记的指纹数据分别作聚类分析,结果表明:标记Hpms1-69和Hpms2-281的鉴别能力较强。再用标记Hpms1-69... 从辣椒基因组的75个SSR标记中筛选出15个多态性较好的标记,用于构建12个辣椒杂交种的数字化指纹图谱。在构建指纹图谱的基础上,用每个标记的指纹数据分别作聚类分析,结果表明:标记Hpms1-69和Hpms2-281的鉴别能力较强。再用标记Hpms1-69和Hpms2-281的指纹数据分别与其他标记的指纹数据进行三标记组合,进行聚类分析,结果表明:约30%的三标记组合能鉴别参试杂交种,其中又以标记组合Hpms1-69+Hpms2-281+CA514272和Hpms1-69+Hpms2-281+BM61461为优。此外,15个SSR标记在12个辣椒杂交种中共检测到38个等位基因,出现两个杂交种指纹图谱完全相同的概率为3.63×10-12,表明这些标记可以用作目前构建辣椒指纹图谱的核心标记。 展开更多
关键词 ssr 指纹图谱 辣椒
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国家冬油菜区试新品种SSR指纹图谱构建与遗传关系分析 被引量：32
12
作者 许鲲 张冬晓 +4 位作者 伍晓明 陆光远 刘凤兰 陈碧云 高桂珍 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期29-34,共6页
采用从200对SSR引物筛选中获得的18对多态性好、带纹清晰的引物,对2005~2006年度国家区试102份冬油菜新品种PCR扩增,获得88条谱带,平均每对引物4.9条,多态性比率平均达到86.36%,PIC平均值为0.64,构建了该年度国家区试102份冬油菜新品种... 采用从200对SSR引物筛选中获得的18对多态性好、带纹清晰的引物,对2005~2006年度国家区试102份冬油菜新品种PCR扩增,获得88条谱带,平均每对引物4.9条,多态性比率平均达到86.36%,PIC平均值为0.64,构建了该年度国家区试102份冬油菜新品种DNA指纹图谱。聚类分析表明,所有参试品种在相似系数0.725处被划分为A、B、C、D、E、F、G7个簇。其中A簇包括81份品种,其他21份参试品种分布在余下的6簇。聚类分析表明,A簇内华中农业大学与湖南省品种有相近亲缘关系,聚成一组;而中国农业科学院油料作物所、贵州油料作物研究所以及陕西地区部分品种相似系数高,聚成另一组,分别拥有37和42份材料。聚类分析同时显示,同一单位的育成品种遗传背景相近。 展开更多
关键词 冬油菜新品种 区域试验 ssr技术 DNA指纹图谱
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花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建 被引量：13
13
作者 任小平 郑艳丽 +8 位作者 黄莉 陈玉宁 周小静 陈伟刚 雷永 晏立英 万丽云 廖伯寿 姜慧芳 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期563-571,共9页
根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参... 根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参考其所在染色体位置,获得60对具有丰富的多态性、广泛的代表性、均匀分布的SSR引物,同时普通引物和荧光引物都具有较好的扩增效果,作为花生品种构建指纹图谱的核心引物。60对SSR引物在100份材料中共扩增出352个多态性等位位点,引物扩增的等位位点均值为5.87;每对引物可区分的基因型数目均值是6.35;引物的多态性信息指数（PIC值）均值是0.54。高多态性的SSR引物占66.67%,SSR引物杂合度都在0.06以下。品种间的遗传相似系数变幅为0.530~0.683。构建了100份花生的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可标识一个品种,为全国花生品种及资源的DNA指纹数据库的构建奠定基础。 展开更多
关键词 花生 ssr荧光标记 毛细管电泳技术 指纹图谱
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4个加工番茄新品种SSR指纹图谱的构建与品种鉴定 被引量：8
14
作者 王柏柯 余庆辉 +2 位作者 杨生保 帕提古丽 杨涛 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1474-1478,共5页
【目的】探明加工番茄主要品种的遗传变异,建立准确高效的种子纯度鉴定方法。【方法】利用SSR引物对4个加工番茄杂交品种及其8个亲本进行PCR扩增,经4%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,进行带型分析。【结果】从34对SSR引物中筛选出10对扩增产... 【目的】探明加工番茄主要品种的遗传变异,建立准确高效的种子纯度鉴定方法。【方法】利用SSR引物对4个加工番茄杂交品种及其8个亲本进行PCR扩增,经4%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,进行带型分析。【结果】从34对SSR引物中筛选出10对扩增产物具有稳定多态性的引物,这些引物分布在番茄整个基因组,每对引物可以检测到2～4个数目不等的多态性片段,共28个多态性片段,平均2.8个,片段大小介于60～150bp,成功构建出4个加工番茄杂交种及其8个亲本的指纹图谱,并鉴定出了这4个杂交种的共显性标记。【结论】这些标记不仅可用于亲本材料和杂交品种的真伪鉴别,还可为杂交种纯度的鉴定提供可靠的方法,对亲本知识权的保护及杂交种推广具有重要意义。 展开更多
关键词 ssr标记 指纹图谱 加工番茄 种子检验
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我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱 被引量：12
15
作者 薛建峰 谭美莲 +4 位作者 严明芳 汪磊 傅春玲 王力军 严兴初 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期48-54,共7页
为了解蓖麻品种间的遗传多样性、构建指纹图谱,利用171对SSR及EST-SSR引物对30份国内蓖麻品种和1份法国品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明蓖麻品种间呈中度多态性,平均每位点有2.267个等位基因数,香农指数、期望杂合度和多态... 为了解蓖麻品种间的遗传多样性、构建指纹图谱,利用171对SSR及EST-SSR引物对30份国内蓖麻品种和1份法国品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明蓖麻品种间呈中度多态性,平均每位点有2.267个等位基因数,香农指数、期望杂合度和多态性信息含量(PIC)分别为0.553、0.347和0.289。聚类分析显示在相似系数0.730处将31份蓖麻品种分为7个类群,来源于相同育种单位或相同省区的大部分品种聚在一起。另外,利用10对扩增清晰、多态性好的引物构建了31份蓖麻品种的指纹图谱,可用于品种鉴别。 展开更多
关键词 蓖麻 ssr分子标记 指纹图谱 遗传多样性 亲缘关系
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三个高含油量甘蓝型油菜新品系SSR指纹图谱的构建 被引量：14
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作者 刘梓谕 王新发 +2 位作者 刘贵华 华玮 王汉中 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期389-396,共8页
在80对SSR引物中筛选出9对多态性好、条带清晰、重复性高的引物构建三个高含油量甘蓝型油菜新品系的指纹图谱。结果显示,9对SSR引物构建的指纹图谱可以区分开3个高含油量品系和其他138个对比品种;运用引物组合法构建这3个高含油量品系... 在80对SSR引物中筛选出9对多态性好、条带清晰、重复性高的引物构建三个高含油量甘蓝型油菜新品系的指纹图谱。结果显示,9对SSR引物构建的指纹图谱可以区分开3个高含油量品系和其他138个对比品种;运用引物组合法构建这3个高含油量品系的指纹图谱,大大提高了图谱的特异性;虽然同一品系不同单株间在DNA水平上存在微弱差异,但利用UPGMA法聚类分析表明,三个品系各自聚类在一组并与其他对比品种区分开。 展开更多
关键词 ssr标记 甘蓝型油菜 指纹图谱 非加权类平均法
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基于KASP标记的芥菜种质资源分子身份证构建
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作者 朱海峰 王天鹏 +6 位作者 全瀚仪 陈海旭 蔡旭 梁建丽 武剑 李梅兰 王晓武 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第3期34-45,共12页
利用由588份芥菜材料重测序分析获得9000个SNP的数据集,开发了覆盖芥菜全基因组的111个KASP标记。在对187份不同类型芥菜种质资源分子标记和表型分析的基础上,剔除了21份基因型重复,表型高度相似的材料。基于“用最少标记区分最多品种... 利用由588份芥菜材料重测序分析获得9000个SNP的数据集,开发了覆盖芥菜全基因组的111个KASP标记。在对187份不同类型芥菜种质资源分子标记和表型分析的基础上,剔除了21份基因型重复,表型高度相似的材料。基于“用最少标记区分最多品种”的原则,筛选出61个能够用于芥菜材料鉴定的KASP标记,利用这些标记的分型数据,构建了芥菜的基因型数字编码——指纹码;同时,对芥菜生产上重要的形态学性状(叶色、叶形、叶缘缺刻、包心情况、株高和膨大部位)进行调查,结合芥菜类型信息,构建了芥菜的表型数字编码——性状码。综合指纹码和性状码,构建166份芥菜材料的分子身份证二维码,为芥菜种质资源和品种的数字化管理奠定了重要基础。 展开更多
关键词 芥菜 种质资源 KASP标记 指纹图谱 分子身份证
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浙江省46个粳稻新品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量：6
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作者 李小华 叶胜海 +6 位作者 赵小燕 姚坚 刘继云 陈蕾 翟荣荣 金庆生 张小明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期1158-1163,共6页
采用农业部推荐的12对水稻SSR引物（NY/T 1433—2007）,对2008年以来由浙江省主要育种单位育成的46个常规粳稻品种构建DNA指纹图谱,并分析其亲缘关系。结果显示,12对SSR引物共检测出84个等位基因,平均多态性频率（FP）值为0.192。46个... 采用农业部推荐的12对水稻SSR引物（NY/T 1433—2007）,对2008年以来由浙江省主要育种单位育成的46个常规粳稻品种构建DNA指纹图谱,并分析其亲缘关系。结果显示,12对SSR引物共检测出84个等位基因,平均多态性频率（FP）值为0.192。46个品种的相似系数在0.735～1.000之间,平均相似系数为0.879,表明近年来浙江省粳稻品种亲缘较近,遗传背景较狭窄。该研究结果可为浙江省水稻新品种选育、鉴别和保护提供参考。 展开更多
关键词 常规粳稻 指纹图谱 ssr标记 遗传多样性
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新疆陆地棉SSR标记指纹图谱构建和杂种纯度鉴定研究 被引量：18
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作者 秦利 李冰 +3 位作者 范玲 李磊 胡保民 王沛政 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2005年第6期399-401,共3页
以新疆近50年来的50个陆地棉种质资源及品种为试材,从50对SSR引物中筛选出10对多态性好的引物,就可以建立新疆陆地棉品种的指纹图谱,每对引物可以检测到1～4个数目不等的多态性片段(allele), 10对引物共检测到27个多态性片段,平均为2.7... 以新疆近50年来的50个陆地棉种质资源及品种为试材,从50对SSR引物中筛选出10对多态性好的引物,就可以建立新疆陆地棉品种的指纹图谱,每对引物可以检测到1～4个数目不等的多态性片段(allele), 10对引物共检测到27个多态性片段,平均为2.7个,片段大小介于85～300 bp.从10对引物中随机挑选了3对引物对当前新疆主栽品种进行了指纹图谱构建和杂交种纯度鉴定的实践验证. 展开更多
关键词 陆地棉 指纹图谱 纯度鉴定 ssr
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基于SSR标记的刺参不同地理群体的遗传结构分析及指纹图谱构建 被引量：5
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作者 廖梅杰 王锦锦 +4 位作者 李彬 王印庚 荣小军 张正 范瑞用 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第1期165-176,共12页
为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构,本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台,韩国浦项、群山、木浦,俄罗斯符拉迪沃斯托克的不同刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示,13个微卫星座位... 为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构,本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台,韩国浦项、群山、木浦,俄罗斯符拉迪沃斯托克的不同刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示,13个微卫星座位的平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.47和0.80。13个位点的多态信息含量(PIC)为0.465(AJ06)~0.909(AJ09),除AJ06为中度多态性(0.25<PIC<0.50)外,其余12个位点均为高度多态性(PIC>0.50)。单个位点的等位基因数(A)为10(AJ06)~34(AJ07),平均等位基因数为19.4个。各位点的有效等位基因共83.8个,各位点的有效等位基因数(Ne)为1.7(AJ06)~11.8(AJ09),平均有效等位基因数为6.5。各群体遗传多样性分析结果显示,8个群体的PIC指数为0.6392(韩国木浦)~0.7122(中国青岛),说明相应群体均具有较高的遗传多样性。构建的DNA指纹图谱可将所采集的8个群体区分开。遗传结构分析结果显示,8个刺参群体分配到3个自由交配群中,与UPGMA聚类分析结果相一致。UPGMA聚类分析结果显示,中国青岛、烟台群体与韩国木浦黑参群体聚为一支,俄罗斯刺参群体、韩国浦项黄参群体、韩国群山黑参群体和韩国浦项黑参群体聚为一支,而韩国浦项红参群体作为外群,单独聚为一支。刺参分群及聚类分析表明,不同群体的遗传结构及遗传分化情况不仅与地理位置相关,还与刺参体色有一定的相关性。本研究结果可为刺参种质资源保护及不同地理种群刺参的鉴别提供技术支撑。 展开更多
关键词 刺参 ssr标记 遗传多样性 指纹图谱
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