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子宫内膜癌预后相关差异表达基因筛选及其生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
乐露露
罗吉
+1 位作者
吴海芳
傅芬
《山东医药》
CAS
2020年第29期19-22,共4页
目的筛选子宫内膜癌(EC)预后相关的差异表达基因(DEGs),并对其进行生物信息学分析。方法从癌症基因组图谱(TCGA)收集临床病理学参数及生存资料完整的EC患者140例,与基因表达综合(GEO)数据库联合筛选DEGs。以各基因表达水平的中位数作为...
目的筛选子宫内膜癌(EC)预后相关的差异表达基因(DEGs),并对其进行生物信息学分析。方法从癌症基因组图谱(TCGA)收集临床病理学参数及生存资料完整的EC患者140例,与基因表达综合(GEO)数据库联合筛选DEGs。以各基因表达水平的中位数作为高低表达的截断值,通过COX回归和Kaplan-Meier曲线筛选预后相关DEGs,并比较不同临床病理参数EC患者预后相关DEGs表达水平。使用基因本体论(GO)及基因组百科全书(KEGG)对预后相关DEGs进行功能通路富集分析。结果TCGA联合GEO数据库共筛选出5个DEGs,即ASPA、MYBL2、TROAP、CCNB2和CDC25C(P均<0.05);5个DEGs中,仅MYBL2基因高低表达EC患者总生存期和无病生存期差异有统计学意义(P均<0.05),且组织低分化、Ⅱ型EC患者MYBL2基因高表达比例分别高于高分化、Ⅰ型患者(P均<0.05)。GO功能富集分析结果显示,MYBL2基因在生物学过程层面主要参与细胞代谢、生物调节等过程,在细胞组成层面主要参与细胞膜、细胞核、大分子复合物等的形成,在分子功能层面主要参与蛋白结合、核酸结合、核苷酸结合等。KEGG通路分析结果显示,MYBL2基因与癌症途径、癌症的蛋白聚糖、细胞周期、细胞凋亡和人类T淋巴病毒感染通路有关(P均<0.05)。结论成功筛选出EC预后相关DEGs为MYBL2,该基因通过多种途径参与EC的发生发展过程,可作为EC治疗的分子靶标和诊断生物标志物。
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关键词
子宫内膜癌
生物信息学
发病机制
预后
差异表达
基因
mybl2基因
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职称材料
题名
子宫内膜癌预后相关差异表达基因筛选及其生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
乐露露
罗吉
吴海芳
傅芬
机构
南昌大学第二附属医院
南昌大学医学院
出处
《山东医药》
CAS
2020年第29期19-22,共4页
基金
江西省自然基金重大项目(20161ACB20022)。
文摘
目的筛选子宫内膜癌(EC)预后相关的差异表达基因(DEGs),并对其进行生物信息学分析。方法从癌症基因组图谱(TCGA)收集临床病理学参数及生存资料完整的EC患者140例,与基因表达综合(GEO)数据库联合筛选DEGs。以各基因表达水平的中位数作为高低表达的截断值,通过COX回归和Kaplan-Meier曲线筛选预后相关DEGs,并比较不同临床病理参数EC患者预后相关DEGs表达水平。使用基因本体论(GO)及基因组百科全书(KEGG)对预后相关DEGs进行功能通路富集分析。结果TCGA联合GEO数据库共筛选出5个DEGs,即ASPA、MYBL2、TROAP、CCNB2和CDC25C(P均<0.05);5个DEGs中,仅MYBL2基因高低表达EC患者总生存期和无病生存期差异有统计学意义(P均<0.05),且组织低分化、Ⅱ型EC患者MYBL2基因高表达比例分别高于高分化、Ⅰ型患者(P均<0.05)。GO功能富集分析结果显示,MYBL2基因在生物学过程层面主要参与细胞代谢、生物调节等过程,在细胞组成层面主要参与细胞膜、细胞核、大分子复合物等的形成,在分子功能层面主要参与蛋白结合、核酸结合、核苷酸结合等。KEGG通路分析结果显示,MYBL2基因与癌症途径、癌症的蛋白聚糖、细胞周期、细胞凋亡和人类T淋巴病毒感染通路有关(P均<0.05)。结论成功筛选出EC预后相关DEGs为MYBL2,该基因通过多种途径参与EC的发生发展过程,可作为EC治疗的分子靶标和诊断生物标志物。
关键词
子宫内膜癌
生物信息学
发病机制
预后
差异表达
基因
mybl2基因
Keywords
endometrial carcinoma
bioinformatics
pathogenesis
prognosis
differentially expressed genes
mybl
2
gene
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
子宫内膜癌预后相关差异表达基因筛选及其生物信息学分析
乐露露
罗吉
吴海芳
傅芬
《山东医药》
CAS
2020
3
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参考文献
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