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RRS1在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义
被引量：
1
1
作者
张霞
刘存
+2 位作者
周宝琴
曹奕
侯琳
《中国小儿血液与肿瘤杂志》
CAS
2024年第1期14-21,共8页
目的探究核糖体合成调控因子1(RRS1)在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义。方法使用TARGET数据库分析RRS1在神经母细胞瘤组织中的表达情况,并分析RRS1高表达与神经母细胞瘤病理指标及预后之间的关联,随后使用GEO数据库分析RRS1在神...
目的探究核糖体合成调控因子1(RRS1)在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义。方法使用TARGET数据库分析RRS1在神经母细胞瘤组织中的表达情况,并分析RRS1高表达与神经母细胞瘤病理指标及预后之间的关联,随后使用GEO数据库分析RRS1在神经母细胞瘤细胞系中的表达情况。然后运用慢病毒转染技术过表达或敲低SK-N-AS细胞株中RRS1的表达,采用CCK-8法、平板克隆实验、流式细胞术和Transwell法检测RRS1对肿瘤细胞增殖、凋亡、周期分布和迁移的影响。结果TARGET和GEO数据库分析结果显示,RRS1基因在59例NB组织中高表达(59/150),且其在NB高风险组中的表达明显高于中、低风险组(P<0.01);此外,RRS1 mRNA在NB细胞系中的表达水平明显高于其在对照细胞中的表达(P<0.01)。临床病理相关性分析结果显示,RRS1mRNA的表达水平与NB患者的年龄、MYCN扩增、INSS分期、COG分期及NB患者的死亡(临床回访)(P<0.05)有关;Kaplan-Meier生存分析显示,RRS1高表达组NB患者的总生存时间(OS)较低表达患者的短(P<0.001)。细胞功能实验结果表明,RRS1过表达可促进SK-N-AS细胞株的增殖、周期进程和迁移并抑制细胞凋亡;而RRS1敲低时,实验显示相反的趋势。结论RRS1高表达可能与神经母细胞瘤患者的不良预后相关,其可参与调节神经母细胞瘤细胞的增殖、凋亡、周期进程和迁移。
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关键词
核糖体合成调控因子1
神经母细胞瘤
增殖
凋亡
迁移
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职称材料
紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白的互作与表达分析
2
作者
付丹文
陈亚慧
+1 位作者
杨少华
高峰
《广东农业科学》
CAS
2023年第6期1-9,共9页
【目的】对前期筛选到的紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白(IbERF1、IbPDC、IbPGP19、IbSCF、IbWRKY1、IbJOX4和IbEIN3-2)的互作与表达进行分析,进一步阐明花色素苷在特定时空合成与积累的调控网络。【方法】采用酵母双杂交和双分子荧光互...
【目的】对前期筛选到的紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白(IbERF1、IbPDC、IbPGP19、IbSCF、IbWRKY1、IbJOX4和IbEIN3-2)的互作与表达进行分析,进一步阐明花色素苷在特定时空合成与积累的调控网络。【方法】采用酵母双杂交和双分子荧光互补试验,对7个调控因子之间的相互作用进行检测,使用荧光定量PCR对紫心甘薯和白心甘薯根不同发育时期花色素苷合成调控和筛选的上游调控因子进行基因表达特征分析。【结果】IbERF1与IbSCF、IbWRKY1存在相互作用。双分子荧光互补试验证实了酵母双杂交的试验结果。IbERF1基因在紫心甘薯根不同时期的表达量均低于白心甘薯,且随着根中花色素苷的积累其表达量逐渐降低,IbWRKY1和IbSCF基因在紫心甘薯和白心甘薯根不同发育时期中的表达量,与花色素苷的积累无明显的相关关系。【结论】IbMYB1上游调控蛋白IbERF1、IbSCF可分别与IbWRKY1形成复合物,以转录复合体的形式共同调控IbMYB1表达。推测IbERF1可能负调控花色素苷的合成,IbSCF和IbWRKY1参与紫心甘薯花色素苷的合成与调控,可能还存在更为复杂的机制。
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关键词
紫心甘薯
花色素苷生物
合成
转录
因子
IbMYB
1
上游
调控
蛋白互作
表达分析
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职称材料
题名
RRS1在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义
被引量：
1
1
作者
张霞
刘存
周宝琴
曹奕
侯琳
机构
青岛市中心血站
青岛大学附属青岛市第三人民医院检验科
青岛大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室
出处
《中国小儿血液与肿瘤杂志》
CAS
2024年第1期14-21,共8页
文摘
目的探究核糖体合成调控因子1(RRS1)在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义。方法使用TARGET数据库分析RRS1在神经母细胞瘤组织中的表达情况,并分析RRS1高表达与神经母细胞瘤病理指标及预后之间的关联,随后使用GEO数据库分析RRS1在神经母细胞瘤细胞系中的表达情况。然后运用慢病毒转染技术过表达或敲低SK-N-AS细胞株中RRS1的表达,采用CCK-8法、平板克隆实验、流式细胞术和Transwell法检测RRS1对肿瘤细胞增殖、凋亡、周期分布和迁移的影响。结果TARGET和GEO数据库分析结果显示,RRS1基因在59例NB组织中高表达(59/150),且其在NB高风险组中的表达明显高于中、低风险组(P<0.01);此外,RRS1 mRNA在NB细胞系中的表达水平明显高于其在对照细胞中的表达(P<0.01)。临床病理相关性分析结果显示,RRS1mRNA的表达水平与NB患者的年龄、MYCN扩增、INSS分期、COG分期及NB患者的死亡(临床回访)(P<0.05)有关;Kaplan-Meier生存分析显示,RRS1高表达组NB患者的总生存时间(OS)较低表达患者的短(P<0.001)。细胞功能实验结果表明,RRS1过表达可促进SK-N-AS细胞株的增殖、周期进程和迁移并抑制细胞凋亡;而RRS1敲低时,实验显示相反的趋势。结论RRS1高表达可能与神经母细胞瘤患者的不良预后相关,其可参与调节神经母细胞瘤细胞的增殖、凋亡、周期进程和迁移。
关键词
核糖体合成调控因子1
神经母细胞瘤
增殖
凋亡
迁移
Keywords
RRS
1
Neuroblastoma
Proliferation
Apoptosis
Migration
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白的互作与表达分析
2
作者
付丹文
陈亚慧
杨少华
高峰
机构
华南师范大学生命科学学院
广东省科学院南繁种业研究所
出处
《广东农业科学》
CAS
2023年第6期1-9,共9页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515110300)。
文摘
【目的】对前期筛选到的紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白(IbERF1、IbPDC、IbPGP19、IbSCF、IbWRKY1、IbJOX4和IbEIN3-2)的互作与表达进行分析,进一步阐明花色素苷在特定时空合成与积累的调控网络。【方法】采用酵母双杂交和双分子荧光互补试验,对7个调控因子之间的相互作用进行检测,使用荧光定量PCR对紫心甘薯和白心甘薯根不同发育时期花色素苷合成调控和筛选的上游调控因子进行基因表达特征分析。【结果】IbERF1与IbSCF、IbWRKY1存在相互作用。双分子荧光互补试验证实了酵母双杂交的试验结果。IbERF1基因在紫心甘薯根不同时期的表达量均低于白心甘薯,且随着根中花色素苷的积累其表达量逐渐降低,IbWRKY1和IbSCF基因在紫心甘薯和白心甘薯根不同发育时期中的表达量,与花色素苷的积累无明显的相关关系。【结论】IbMYB1上游调控蛋白IbERF1、IbSCF可分别与IbWRKY1形成复合物,以转录复合体的形式共同调控IbMYB1表达。推测IbERF1可能负调控花色素苷的合成,IbSCF和IbWRKY1参与紫心甘薯花色素苷的合成与调控,可能还存在更为复杂的机制。
关键词
紫心甘薯
花色素苷生物
合成
转录
因子
IbMYB
1
上游
调控
蛋白互作
表达分析
Keywords
purple-fleshed sweet potato
anthocyanin biosynthesis
transcription factor IbMYB
1
transcription proteins interaction
expression analysis
分类号
S531 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
RRS1在神经母细胞瘤组织和细胞中的表达及意义
张霞
刘存
周宝琴
曹奕
侯琳
《中国小儿血液与肿瘤杂志》
CAS
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
紫心甘薯IbMYB1上游7个调控蛋白的互作与表达分析
付丹文
陈亚慧
杨少华
高峰
《广东农业科学》
CAS
2023
0
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已选择
0
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