目的:利用中医传承辅助平台分析侯炜教授治疗脑胶质瘤的用药规律,并通过网络药理学方法探讨核心药组多成分-多靶点-多通路治疗脑胶质瘤的作用机制。方法:严格按照疗效判定标准筛选处方,利用关联规则分析显效及有效处方,在TCMSP数据库筛...目的:利用中医传承辅助平台分析侯炜教授治疗脑胶质瘤的用药规律,并通过网络药理学方法探讨核心药组多成分-多靶点-多通路治疗脑胶质瘤的作用机制。方法:严格按照疗效判定标准筛选处方,利用关联规则分析显效及有效处方,在TCMSP数据库筛选核心药组的有效成分及靶点,并与OMIM、TTD、GeneCard、DisGeNET数据库筛选所得脑胶质瘤基因取交集,得到候选靶点。借助Cytoscape 3.8.0构建“化合物-靶点-疾病”网络,在STRING平台构建PPI网络,设置拓扑参数筛选核心靶点。利用Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,通过AutoDock Vina软件和Python脚本将核心化合物与核心靶点进行分子对接。结果:共纳入方剂249首,挖掘得到核心药物组合,并筛选活性成分227个,候选靶点30个,KEGG通路165条和GO功能739个。KEGG通路主要为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)信号通路、低氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、癌症相关信号通路。分子对接显示靶点与成分结合活性良好。结论:核心药组可能通过肿瘤蛋白P53、肿瘤坏死因子、MAPK1、MAPK8等靶标作用于MAPK信号通路、HIF-1信号通路及癌症相关信号通路等发挥作用。展开更多
文摘目的:利用中医传承辅助平台分析侯炜教授治疗脑胶质瘤的用药规律,并通过网络药理学方法探讨核心药组多成分-多靶点-多通路治疗脑胶质瘤的作用机制。方法:严格按照疗效判定标准筛选处方,利用关联规则分析显效及有效处方,在TCMSP数据库筛选核心药组的有效成分及靶点,并与OMIM、TTD、GeneCard、DisGeNET数据库筛选所得脑胶质瘤基因取交集,得到候选靶点。借助Cytoscape 3.8.0构建“化合物-靶点-疾病”网络,在STRING平台构建PPI网络,设置拓扑参数筛选核心靶点。利用Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,通过AutoDock Vina软件和Python脚本将核心化合物与核心靶点进行分子对接。结果:共纳入方剂249首,挖掘得到核心药物组合,并筛选活性成分227个,候选靶点30个,KEGG通路165条和GO功能739个。KEGG通路主要为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)信号通路、低氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、癌症相关信号通路。分子对接显示靶点与成分结合活性良好。结论:核心药组可能通过肿瘤蛋白P53、肿瘤坏死因子、MAPK1、MAPK8等靶标作用于MAPK信号通路、HIF-1信号通路及癌症相关信号通路等发挥作用。
