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产蛋高峰期高低产隐性白羽肉种鸡盲肠微生物差异性分析
1
作者 章易培 王东贤 +8 位作者 朱焜炜 袁钊 王巧 李想 王子渲 郑矩梅 赵桂苹 刘铮铸 李祥龙 《中国家禽》 北大核心 2025年第10期155-160,共6页
试验旨在筛查隐性白羽肉种鸡产蛋高峰期影响母鸡产蛋水平的关键盲肠微生物。试验随机选取产蛋高峰期(184~210日龄,共27 d)的15只高产鸡和14只低产鸡分别设为高产组(M)和低产组(L),采用16S rRNA法分析了高产组和低产组试验鸡盲肠微生物... 试验旨在筛查隐性白羽肉种鸡产蛋高峰期影响母鸡产蛋水平的关键盲肠微生物。试验随机选取产蛋高峰期(184~210日龄,共27 d)的15只高产鸡和14只低产鸡分别设为高产组(M)和低产组(L),采用16S rRNA法分析了高产组和低产组试验鸡盲肠微生物群落的组成情况。结果显示,在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidota)在高、低产组试验鸡盲肠微生物中相对丰度均为最高,其次是厚壁菌门(Firmicutes),但两组间无显著差异(P>0.05);在科水平上,拟杆菌科(Bacteroidaceae)在两组中相对丰度均为最高,乳酸杆菌科(Lactobacillaceae)和普雷沃菌科(Prevotellaceae)在高产组中相对丰度显著高于低产组(P<0.05);在属水平上,拟杆菌属(Bacteroides)在两组中的相对丰度均为最高,高产组乳酸杆菌属(Lactobacillus)的相对丰度显著高于低产组(P<0.05)。进一步对两组试验鸡盲肠微生物的属水平进行随机森林分析,发现乳酸杆菌属(Lactobacillus)是影响产蛋性状最重要的细菌属。研究表明,乳酸杆菌可能是影响母鸡产蛋高峰期产蛋水平的关键盲肠微生物。 展开更多
关键词 肉种鸡 产蛋高峰期 产蛋数 盲肠 微生物
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基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因 被引量：2
2
作者 王子渲 王巧 +8 位作者 张锦 Astrid Lissette Barreto Sanchez 郑麦青 李庆贺 崔焕先 安炳星 赵桂苹 文杰 李和刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1905-1914,共10页
旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条... 旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM 29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律,并鉴定到与耐热相关的候选基因,为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。 展开更多
关键词 北京油鸡 广明白鸡 热应激 差异表达基因 加权基因共表达网络分析
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策勒黑羊ERα基因克隆、生物信息学分析及卵巢组织表达研究 被引量：1
3
作者 张继虎 米热妮萨 +3 位作者 王子渲 李琳 邢凤 刘书东 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第5期1679-1687,共9页
【目的】克隆策勒黑羊雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)序列并进行生物信息学分析,同时测定策勒黑羊卵巢中ERα基因的表达情况。【方法】利用RT-PCR和TA克隆方法获得策勒黑羊ERα基因序列,并采用在线软件对其进行生物信息学分析... 【目的】克隆策勒黑羊雌激素受体α(estrogen receptorα,ERα)序列并进行生物信息学分析,同时测定策勒黑羊卵巢中ERα基因的表达情况。【方法】利用RT-PCR和TA克隆方法获得策勒黑羊ERα基因序列,并采用在线软件对其进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR方法检测ERα基因在策勒黑羊卵泡期、黄体期和妊娠30 d母羊卵巢中的表达情况。【结果】成功克隆获得策勒黑羊ERα基因序列,长1791 bp,编码596个氨基酸,与山羊和牛的相似性最高。生物信息学分析显示,ERα蛋白分子式为C_(2930)H_(4600)N_(822)O_(862)S_(41),理论等电点(pI)为7.32,不稳定指数为50.33,为不稳定亲水性蛋白;存在28个O-糖基化位点和54个磷酸化位点,不存在N-糖基化位点;主要定位在细胞核中,不具备跨膜结构;二级结构主要为α-螺旋及无规则卷曲。实时荧光定量PCR检测显示,ERα基因在策勒黑羊卵泡期、黄体期和妊娠30 d的卵巢中均有表达,与卵泡期相比,黄体期ERα基因表达量极显著下降(P<0.01),妊娠30 d ERα基因表达量极显著升高(P<0.01)。【结论】策勒黑羊ERα基因序列长1791 bp,编码596个氨基酸,为亲水蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。ERα基因在策勒黑羊卵泡期、黄体期和妊娠30 d的卵巢中均有表达。本研究结果为进一步探究ERα基因在策勒黑羊卵巢卵泡发育、黄体形成和妊娠中发挥的作用提供参考。 展开更多
关键词 策勒黑羊 ERα基因 克隆 表达
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